世宗嘉靖四十三年秋七月、以諭德張居正充裕王講官．
穆宗隆慶元年二月、加恩侍從藩邸諸臣、以禮部右侍郎張居正為吏部左侍郎兼東閣大學士、直內閣．四月、進禮部尚書、武英殿大學士．
二年春正月、進大學士張居正少保．
八月、居正上疏陳大本急務六事：「一曰省議論．凡事不貴無用之虛詞、務求躬行之實效．欲為一事、須審之於初．及計慮已審、即斷而行之、如唐憲宗之討淮、蔡、雖百方沮之而不為搖．欲用一人、須慎之於始．既得其人、則信而任之、如魏文侯之用樂羊、雖謗書盈篋而終不為之動．一日振紀綱．近年以來、綱紀不肅、猥以模棱兩可謂之調停、以委曲遷就謂之善處．伏望刑賞予奪、一歸公道、而不曲徇乎私情．政教號令、一斷宸衷、而勿紛更於浮議．一曰重詔令．近日以來、朝廷詔旨、多格廢不行、至十餘年未竟者．文卷委積、多致沈埋．年月既遠、事多失真．遂使漏網終逃、國有不中之法；覆盆自苦、人懷不白之寃．是非何由而明、賞罰何由而當？伏乞敕下各司、嚴立限期、責令奏報、違者查參．一曰覈名實．器必試而後知其利鈍、馬必駕而後知其駑良、今用人則不然．官不久任、事不責成、更調太繁、遷轉太驟、資格太拘、毀譽失實．臣願皇上慎重名器、愛惜爵賞．用人必攷其終、授人必求其當．仍敕吏部嚴考課之法、審名實之歸．一曰固邦本．今風俗侈靡、官民服舍、俱無定制．外之豪強兼併、賦役不均、花分詭寄、偏累小民．乞敕內外諸司、悉心清理．一曰飭武備．今議者皆曰：兵不多、食不足、將帥不得其人．臣以為此三者皆不足患也．夫兵不患少而患弱．今軍位雖缺、而糧具存．若能按籍徵求、清查冒占、隨宜募補、從實訓練、何患無兵！捐無用不急之費、以撫養戰鬬之士、何患無財！懸重賞以勸有功、寬文法以伸將權、則忠勇之夫孰不思奮、又何患於無將！至於目前自守之策、莫要於選擇邊吏、團練鄉兵、併守墩堡．臣考前代及吾祖宗、俱有大閱之禮、以習武事而戒不虞．今京師內外、守備單弱、伏乞敕戎政大臣、申嚴軍政、設法訓練．每歲農隙之時、恭請大閱、以試將帥之能否、軍士之勇怯．注意武備、整飭戎事、亦足以伐外寇之謀、銷未萌之患．」疏入、上曰：「覽卿奏、皆深切時務、具見謀國忠悃、所司詳議以聞．」於是都御史王廷等覆「振紀綱、重詔令」二事、析為八則．疏上、上允行之．兵部覆飭武備事宜：「一議兵、一議將、一議團練鄉兵、一議守城堡、一議整飭京營．」又奏：「大閱之禮、宣宗、英宗嘗行之．恭請親臨較閱、如閣臣所奏．」上曰：「大閱既有祖宗成憲、允宜修舉．其先期整飭、俟明年八月舉行．餘悉如議．」戶部議固邦本、言「財用之當經理者有十、宜嚴法整飭」．上一一允行之．
十二月、廢遼王．大學士張居正故隸遼王尺籍、至憲㸅、頗驕酗、多所凌轢、居正銜之、而又羨其府第壯麗．會告王謀反、刑部訊治．侍郎洪朝選案驗無謀反狀、僅坐以淫酗、憲㸅錮高牆、廢其府、居正攘以為第．後復恚朝選不附反律、謀殺朝選．
三年九月、上大閱於京營教場、敕諭戎政官及諸吏卒．先是、給事中駱問禮言：「大閱非今時所急、不必仰煩聖駕．」居正力持其說、上遂行之．
四年十二月、大學士張居正秩滿、進兼太子太傅、吏部尚書、進少傅、兼建極殿大學士．
六年春正月、進大學士張居正少師．
五月、上不豫．己酉、大漸、召閣臣高拱、張居正、高儀至乾清宮受顧命．上倚坐御榻、皇后及皇貴妃咸侍、東宮立於左．上困甚、太監馮保宣顧命曰：「朕嗣統方六年、今疾甚、殆不起、有負先帝付託．東宮幼沖、以屬卿等．宜協輔、遵守祖制、則社稷功也．」拱等泣拜而出．翼日、上崩．
六年甲子、皇太子即位、年始十歲．時太監馮保方居中用事、矯傳大行遺詔云：「閣臣與司禮監同受顧命．」廷臣聞之俱駭．一日、內使傳旨至閣．拱曰：「旨出何人？上沖年、皆若曹所為、吾且逐若曹矣．」內臣還報、保失色、謀逐拱．拱與居正俱負氣不相下、居正乃結保自固．時臺諫交劾保、必欲斥之．而高拱自以與居正及高儀同預凴几、每慷慨收宮府權曰：「老臣謬膺託孤、不敢不竭股肱．凡內降命敕、府部章奏、自合公聽並觀．有傳奉中旨、所司按法覆奏、白老臣折衷之、以復百官總己之義．」拱內慮馮保專恣、與居正、儀謀去之．居正陰洩之保、乃與保謀去拱．六月既望、庚午昧爽、拱在直、居正引疾．召諸大臣於會極門、促居正至、拱以為且逐保也．保傳皇后、皇貴妃、皇帝旨曰：「告爾內閣、五府、六部諸臣．大行皇帝賓天、先一日、召內閣三臣御榻前、同我母子三人、親受遺囑曰：『東宮年少、賴爾輔導．』大學士拱、攬權擅政、奪威福自專、通不許皇帝主管、我母子日夕驚懼．便令回籍閒住、不許停留．爾等大臣、受國厚恩、如何阿附權臣、蔑視幼主！自今宜洗滌忠報、有蹈往轍、典刑處之！」拱即日出朝門、得一牛車、立而附載、緹騎番兵踉蹌追逐、喪厥資斧、大臣去國、以為異聞．拱去、居正為乞馳驛、乃傳歸．而高儀未幾亦卒以病死、居正裒然首輔矣．
辛酉、上御平臺、召張居正慰勞之曰：「皇考屢稱先生忠臣．」居正頓首泣謝曰：「今國家要務、惟在遵守舊制、不必紛更．至於講學親賢、愛民節用、又君道所先、乞聖明留意．」上曰：「善．」隨賜酒饌銀幣．居正既柄政、慨然以天下為己任、中外想望丰采、一意尊主權、課吏實．嘗言：「高皇帝得聖之威者也．世宗能識其意、是以高臥法宮之中、朝委裘而不亂．今上、世宗孫也、奈何不法祖！」具詔草請於上、召羣臣廷飭之、百寮惕然．
八月、張居正請開經筵、復請更定常朝日期、御門聽政．俱從之．上遂御文華殿、日講以為常．
十一月、太監崔敏請買金珠寶石．居正上言：「前六月間、奉命停止、今忽有此舉、是前詔不信也．乞暫停之、以甦民力．」因封還敏疏、遂報罷．
十二月、張居正進《帝鑑圖說》．上見捧冊進、喜動顏色、遽起立、命左右展冊．居正從旁指陳大義、上應如響．因即宣付史館、賜居正銀幣．一日、上御文華殿講畢、覽至漢文帝勞軍細柳事．居正因言：「皇上當留意武備．祖宗以武功定天下、承平日久、武備日弛、不可不及早講求也．」上稱善．
甲戌、張居正奏請明年正月上旬、即御殿日講．但先帝喪未期、勿設宴、并免元夕燈火．上曰：「已早停止．每侍聖母膳、甚簡素．或逢節日、具果宴、不設樂．」居正稱善．尋諭光祿卿免節間供應七百餘金．
戊寅、張居正上言：「制敕宜尚簡嚴、近來過為誇侈．臣諛其君、猶謂之佞、況以上諛下乎！乞戒代言諸臣、復古從實、毋壞制體．」從之．
神宗萬曆元年春正月辛卯、命成國公朱希忠、大學士張居正知經筵事．上甚敬禮居正、每日御經筵、居正以詩書入、在文華殿後、張小幄、造膝密語．一日、居正在直廬感病、上御煖閣、親調椒湯賜之．盛暑御講、上就居正立處、令內使搖扇．隆冬進講、以氈片鋪地．
庚子、早朝．上出乾清宮、見一無鬚男子、偽作宦者狀、袖有佩刀、趨走惶遽．左右執之、馮保立鞫之．曰：「南兵王大臣．」「奚自？」曰：「自總兵戚繼光來．」保使密報居正．而居正令附保耳曰：「戚公方握南北軍、禁無妄指、可借以除高氏．」保故甘心陳內監洪、已逮洪、錮禁獄、令大臣供之矣．先是、大臣為戚帥三屯營南兵、不遂、流落都下．為人巧捷便佞、一中貴昵之．至是、令稱拱使、改籍武進縣．即令廁卒辛儒、衣大臣蟒袴、予二劍、劍首飾猫精異寶、送繫廠中．入以聞、請究主使人．居正亦上疏如保意．上即付保鞫．保令辛儒屏語大臣曰：「第言高相君怨望、使汝來刺．願先首免罪、即官汝錦衣、賞千金．不然、重榜掠死矣．」因使儒畀大臣金、美飲食之．儒日與大臣狎款、即令誣拱家人為同謀．獄具、保飛發五校械拱僕．而居正前疏傳中外、口語籍籍、謂且逮拱．居正乃密謀於吏部尚書楊博．博曰：「迫之恐起大獄．抑上神聖英銳、持公平察．高公雖粗暴、天日在上、安得有此！」居正面赤不懌．會大理少卿李幼孜者、居正鄉人、亦輿疾告居正曰：「公奈何為此？惡名污青史矣．」居正強應曰：「吾為此事、憂不如死、何謂我為？」居正禁科、道官不得有言．而御史鍾繼英上疏不敢明言、暗指之．居正怒、擬旨詰問．左都御史葛守禮語楊博：「過張公、必諍之．」博曰：「向已告矣．」守禮曰：「輿望屬公、謂公能不殺人媚人耳．大獄將起、公奈何以已告為解？」即共過居正．居正曰：「東廠獄具矣．同謀人至、即疏處之耳．」守禮曰：「守禮敢附亂臣黨耶！願以百口保高公．」居正默不應．博曰：「願相公持公議、扶元氣、廠中寧有良心？倘株連者眾、事更有不可知者．」居正堅不承．博與守禮因歷數先朝政府、同心輔政、及貴溪、分宜、華亭、新鄭遞相傾軋、相名坐損、可為殷鑒．居正憤曰：「二公意我甘心高公耶？」奮入內、取廠中揭帖投博曰：「是何與我？」揭帖有居正竄改四字、曰「歷歷有據」、而居正忘之．守禮識居正手跡、笑而納諸袖．居正覺曰：「彼法理不諳、我為易數字耳．」守禮曰：「機密重情、不即上聞、先政府耶？吾兩人非謂相公甘心高公、以回天非相公不能．」居正揖謝曰：「苟可效、敢不任、第何以善後？」博曰：「相公患不任耳、任則何難善後！須得一有力世家、與國休戚者、乃可委治．」居正悟、始言上前度處之．上即命馮保與左都御史葛守禮、都督朱希孝會審．而希孝懼、與其兄成國公希忠相對泣曰：「誰畫此策也、以覆吾宗！」急詣居正請命．居正曰：「第見冢宰大中丞．」希孝泣謁博、博曰：「欲借公全朝廷宰相體耳、何忍以身家陷公！顧亦何難、公第使善詗校尉入獄、訊刀劍口語所從來、雜高家僕稠眾中、令別識．且問見高公何所？今在何地？立辨矣．」希孝如博言、使善詗校尉密詢大臣何自來？則來自保所、語盡出保口．校尉即告大臣：「入宮謀逆者、法族．奈何甘此？若吐實、或免罪．」大臣茫然哭曰：「始紿我主使者罪大辟、自首無恙、官且賞．豈知當實言！」適高家僕逮至、希孝雜諸校中、令揚色、大臣不辨也．及會審、風霾大晦、尋雨雹不止．東廠理刑白一清者、謂保初問官二千戶曰：「天意若此、可不畏乎？高相國顧命大臣、本無影響、強我誣之．我輩皆有身家、異日寧免誅戮耶？」皆曰：「馮公已為具詞、固有陰持之者、奈何？」一清曰：「東廠機密重情、安得送閣改乎？」頃之、天稍明、出大臣會問．故事、先雜治．大臣呼曰：「故許我富貴、何雜治也？」馮保即問曰：「誰主使者？」大臣瞪目仰面曰：「爾使我、乃問也？」保氣奪、強再問：「爾言高相國、何也？」曰：「汝教我、我則豈識高相國？」希孝復詰其蟒袴刀劍、曰：「馮家僕辛儒所予．」保益懼．希孝曰：「爾欲污獄使耶！」遂罷．保密飲大臣生漆酒、瘖之、而內以拱行刺事上聞．有殷內監者、年七十餘、奏上曰：「高拱故忠臣、何為有此？」隨顧保曰：「高鬍子是正直人．張居正故懷忮刻、必殺之．我輩內官、何須助彼！」保大沮．而內監張宏亦力言不可．於是上下刑部擬罪、竟論大臣斬．拱被居正齮齕、杜門屏居．仕宦中州者、不敢過新鄭、率枉道他去．
六月、張居正上言：「稽覈章奏、隨事考成、有遷延隱蔽者、即舉劾．」上從之．
冬十月、上御文華殿、張居正進講、言及宋仁宗不喜珠飾．上曰：「賢臣為寶、珠玉何益！」居正曰：「明君貴五穀而賤珠玉、五穀養人、珠玉饑不可食、寒不可衣．」上曰：「然．宮人好冶妝、朕歲賜未嘗不節省．」居正曰：「皇上言及此、社稷生靈之福也．」上又曰：「秦始皇銷兵、梃可傷人、何銷兵為？」居正曰：「人君布德修政、以結民心為本．天下之患、每出所防之外．秦亡於戍卒、故天時不如地利、地利不如人和．」上曰：「然、人定真能勝天也．」
二年春正月、大學士張居正請上引見廉能官、倣祖宗午朝之儀．從之．甲午、上御皇極門、引見朝覲清廉卓異浙江布政使謝鵬舉等二十五人、特加獎勵．各賜金幣、并宴．
張居正進《講章疏》、略曰：「義理必時習而後能悅、學問必溫故而知新．臣今將今歲所進講章、重復刪定《大學》一冊、《虞書》一冊、《通鑑》四冊、進呈睿覽．雖淺近之言、然亦行遠登高之一助．」
四川西南都蠻平．初、隆慶時、都蠻作亂、張居正薦曾省吾往討之．省吾有偉略．而四川總兵劉顯以在閩事被彈、居正曰：「臨敵易將、兵家所忌．倘蜀事不效、當并閩事逮治之．」於是顯奮不顧身、受省吾方略、以平蠻自效．凡六閱月、諸寨悉平、俘蠻長三十六人、拓地四百里．
上御文華殿講畢、問建文果出亡否？張居正曰：「國史不載．但故老相傳、披緇雲遊、題詩於田州、有『流落江湖四十秋』之句．」上太息、命錄詩進．居正曰：「此亡國之事、不足觀也．」請錄《皇陵碑》及高皇《御製集》以上、見創業之艱、聖謨之盛．明日、輔臣進《皇陵碑》．上覽畢、謂居正曰：「朕覽碑、讀之數過、不覺感傷欲泣．」居正曰：「祖宗當日艱難、蓋以天心為心、故能創制顯庸．皇上以聖祖之心為心、乃能永保洪業．」因述聖祖微時事及即位勤儉．上愴然曰：「朕敢不黽勉法祖、然尚賴先生輔導也．」
秋九月辛巳、刑部請錄囚、慈聖太后欲停之．上問張居正、對曰：「春生秋殺、天道之常．皇帝即位以來、停刑者再矣．稂莠不除、反害嘉禾、凶惡不去、反害良民．」上為請、太后從之．
十二月壬子、張居正率大臣上御屏．屏繪天下疆域及職官姓名、用浮帖以便更換．上命設於文華殿後、時加省覽．
閏十二月丁亥、上御書「弼予一人、永保天命」、賜張居正．明日、居正侍、進諫曰：「帝王之學、當務其大．自堯、舜至唐、宋賢主、皆修德行政、治世安民、不以一藝．漢成帝知音律、能吹簫度曲；梁武帝、陳後主、隋煬帝、宋徽宗皆能文、善書畫、無救於亂亡．則君德之大、豈沾沾一藝哉！」他日、上日講畢、問居正：「元夕煙火鼇山、祖制乎？」曰：「非也．成化間、以奉母后、時多諫阻．今新政宜裁．」上曰：「然．」居正曰：「明年雖禫、繼此當大婚、又皇弟潞王出閣、諸公主釐降、所費甚煩、宜預節省．」上曰：「朕極知民窮．」居正請減元日賜賚、上大然之．上又嘗語輔臣曰：「昨日禁中花盛開、侍母后賞宴甚歡．」蓋指慈寧也．居正奏曰：「仁聖太后處多時寂寞、惟皇上念之．」起還宮、白慈聖、即自駕往迎仁聖過大內、賞花傳觴、歡宴而罷．
三年夏五月、大學士張居正上言：「近郡縣入學大濫、宜敕學臣量加裁省．并敕吏部、凡所在督學臣、非方正勿遣．」
遼東告警、上深以為憂．張居正對曰：「暑月非北騎狂逞之時、必無慮．」既而薊遼總兵戚繼光報稱：「諸部解散無警．」居正因上疏論邊事曰：「昨遼東撫臣張學顏報稱：『寇眾二十餘萬謀犯遼東、前鋒已抵大寧．』皇上面諭臣、臣已面奏、料其無事．今據總兵戚繼光報稱：『寇久解散．』臣又使人於宣府密偵西人青把都動靜、則把都在巢駐牧、未嘗東行．遼東所報、皆屬虛聲．臣等因此、反切憂慮．夫兵家之要、必知彼己、審虛實、而後可以待敵取勝．今無端聽一譌言、倉皇失措、則是彼己虛實茫然不知、其與『風聲鶴唳、草木皆兵』者何異？敵情狡詐、萬一彼常以虛聲恐我、使我驚惶疲於奔命、久之懈弛不備、然後卒然而至、措手不及．是在彼反得先聲後實、多方以誤之之策．而在我顧犯不知彼己、百戰百敗之道．他日邊臣失事、必由於此．故臣等不以寇之不來為喜、而深以邊臣不知敵情為慮也．兵部以居中調度為職、猶貴審察機宜、沈謀果斷、乃能折衝樽俎、坐而制勝．今一聞奏報、便爾張皇、事已之後、又寂無語．徒使君父焦勞於上、以憂四方．豈僅以題覆公牘、謂已畢本兵之事耶！乞傳諭兵部、詰以寇情虛實之由、使之知警．并請賑各邊饑卒．」俱從之．
八月、張居正請增閣臣、許之．即日進吏部左侍郎張四維為禮部尚書、入東閣．故事、入閣者、止曰「同某人辦事」．至是、上手注：「隨元輔入閣辦事．」四維恂恂若屬吏矣．
十一月、張居正上《郊祀圖考》、為書三冊．首敍分合沿革之由、次具壇壝陳設、次列儀注樂章．大意遵高皇定制、歲一合祀、奉二祖並配．上褒答之．
四年春正月、御史劉臺劾大學士張居正專擅威福、如逐大學士高拱、私贈成國公朱希忠王爵、引用張四維、張瀚為黨、斥逐言官余懋學、傅應禎、罔上行私、橫黷無厭．居正怒甚．見上辭政、曰：「臣之所處者、危地也．言者以為擅作威福、而臣之所行、正威福也．將巽順以悅下耶？則負國．竭公以事上耶？無以逃專擅之譏．」伏地不肯起．上下御座、手掖之曰：「先生起、朕當責臺以謝先生．」詔下臺獄、杖之百、遠戍之．時議藉藉、居正不自安、復具疏為解、免杖、奪職為民．然心終恨之、後竟置之死．
三月戊戌、上御文華殿、言及唐玄宗於勤政樓宴安祿山．上曰：「樓名勤政、而佚樂何也？」張四維曰：「玄宗開元之治有三代風、至天寶荒佚、乃致播遷．」居正曰：「無論往代、我世宗皇帝初年、西苑建無逸殿、省耕勸農．末年崇尚玄修、不復臨幸、治平之業亦寢．故《大寶箴》云：『民懷其始、未保其終．』」上嘉納之．
五月辛酉、上視朝、張居正等請覽奏章時、閱聖祖所親批疏稿為法．上曰：「然．」居正因簡內閣所藏聖祖手諭六十三道、御製四十四道、聖旨并帖共七十道上之．
秋七月丁酉、張居正上言：「致治之道、莫要於安民．安民之法、莫重於守令．守土牧民者、削下奉上以希聲譽、奔走趨承以求薦舉、徵發期會以完簿書、苟且草率以逭罪責、其實心愛民者、未嘗概見．明春外計考察、舉錯乃向背所係、惟以安靜宜民為最．虛文矯飾、雖浮譽素隆、當列下考．」居正又請行考成法、有司以徵解為殿最．於是奉行者、督責小民、不勝朴楚、相率為怨言、然賦以時起．居正上言：「近者仰賴皇上愛人節用、京、通儲粟、足支八年、太倉銀庫、所積尚少．宜將明年漕糧量折十三、足國裕民、一舉兼得．」上從之．時府庫充溢、太僕寺亦積金四百餘萬．
冬十月丙子、進張居正左柱國太傅、仍加伯爵．敕曰：「先生親受先朝顧命、輔朕沖年．今四海昇平、實賴匡弼．精忠大勳、言不能殫．惟我祖宗列聖、祐爾子孫、與國咸休．欽哉！」居正固辭伯爵、許之．
山東撫按劾昌邑知縣孫鳴鳳貪賄．上怒甚、欲遣逮．張居正曰：「貪人固當盡治、但故事俱下臺訊．」上曰：「然．鳴鳳之婪、乃出進士乎？」居正曰：「此人惟恃進士、故爾恣肆．若乙科明經、尚有畏忌．今後用人、但問功能、不可拘資格．」上深然之．
十二月、上御文華殿、舉袍示輔臣曰：「此何色也？」居正以為青．上曰：「紫也、久而色渝．」居正曰：「紫易渝．昔皇祖不尚袨服、御衣敝甚始易、享國長久、未必不由此．願皇上以皇祖為法、節一衣、民間有數十人得其煖者；輕一衣、民間有數十人受其寒者、不可不念也．」時左右亦言民窮、至鬻妻子應上供．上深然之．
五年春正月庚午、上御文華殿．大學士張居正言：「殿之東堂、祀伏羲以下數聖君、皇上所當法也．法古聖、惟在省覽章奏．日閱一二、講明國事、則他年躬攬萬機無難矣．」上嘉納之．
五月戊申、諭修慈慶、慈寧南宮．張居正言：「兩宮於萬曆二年落成、今壯麗如故、足以娛聖母．乃欲壞其已成、更加藻飾、非所急也．請輟工．」從之．
嶺西羅旁平．羅旁據山海間、驚江急峽、巖壑險絕、諸瑤窟穴其中、前代不入版籍．國初、甫一定之．世宗朝、諸瑤轉相寇掠、不可撲滅．督撫殷正茂既討平惠、潮寇、上疏言羅旁當誅．廷議不能決．居正毅然言當誅、舉兵部尚書凌雲翼、請賜璽書、屬之討賊．雲翼瀕行、居正謂之曰：「雖鞭之長、不及馬腹．即今兩廣諸瑤、雖所在都有、然乘間竊發、要當審所緩急耳．」雲翼既至、部諸路兵號三十萬、八道並進．克木衣山、破諸峒五百六十有四、俘斬四萬二千有奇、拓地數百里、置郡縣．捷聞、賜賚有差．
先是、四方多草竊、有司祕不以聞．張居正特嚴其禁．匿盜者、雖循吏必黜．得盜即報決．有司凜凜、盜亦衰止．
閏八月丁亥、上視朝．張居正因言：「近因陰雨、朝講暫輟．恐中外不知、謂皇上勤學漸不如初．願日慎一日、非有他事及風雨不得輟．」上深然之．
九月、上諭停刑、蓋慈聖太后以大婚期近也．居正上言：「春生秋殺、天道所以運行；雨露霜雪、萬物因之發育．明王奉若天道、刑賞予奪、皆奉天意以行事．若棄有德而不用、釋有罪而不誅、則刑賞失中、慘舒異用矣．且臣近詳閱所開諸犯、皆逆天悖理、其所戕害、含寃蓄憤．聖主明王不為一泄、彼以其怨恨寃苦之氣鬱而不散、或上蒸為妖沴氛祲之變、下或致凶荒疫癘之疾、則其為害又不止一人一家也．請俟明年吉典告成、然後概免一年．」從之．
己卯、張居正父喪訃至、上以手諭宣慰、視粥止哭、絡繹道路、又與三宮賻贈甚厚、然亦無意留之．所善同年李幼孜等倡奪情之說、於是居正惑之、乃外乞守制、示意馮保、使勉留焉．冬十月、居正再上疏乞終制、不允．乃請在官守制、不造朝、許之．居正既父喪奪情、吉服視事．編修吳中行、檢討趙用賢因星變陳言．刑部員外艾穆、主事沈思孝合疏言「居正忘親貪位」、居正大怒．時大宗伯馬自強曲為營解、居正跪而以一手撚鬚曰：「公饒我、公饒我！」掌院學士王錫爵徑造喪次、為之解．居正曰：「聖怒不可測．」錫爵曰：「即聖怒、亦為公．」語未訖、居正屈膝於地、舉手索刃作刎頸狀曰：「爾殺我、爾殺我．」錫爵大驚、趨出．十月二十二日、中行等四人同時受杖．中行、用賢即日驅出國門、人不敢候視．許文穆方以庶子充日講、鐫玉杯一、曰：「斑斑者何？卞生淚．英英者何？藺生氣．追追琢琢永成器．」以贈中行．鐫犀杯一、曰：「文羊一角、其理沈黝．不惜剖心、寧辭碎首．黃流在中、為君子壽．」以贈用賢．穆、思孝復加鐐鎖、且禁獄．越三日、始僉解發戍、為更慘毒．時鄒元標觀政刑部、憤甚、視四人杖畢而疏上．越三日、受杖、謫戍貴州都勻衞．
罷吏部尚書張瀚．先是、瀚為南京工部尚書、廷推吏部、瀚名第三．以居正言、上越次用之．居正以為德、希瀚報．奪情議起、遂邀中旨、屬瀚留居正．居正亦自牘、風之使留己．瀚若不喻其意者、謂：「政府奔喪、當以殊典卹之、宗伯事也、何關吏部？」居正乃令所善客說瀚．瀚不聽、又不欲顯居其名、乃偕三尚書密晤居正、動以微言．居正大不悅、於是有詔切責瀚、謂瀚奉諭不復、無人臣禮．是時、廷臣爭惴慄、各倡保留之議．瀚拊膺太息曰：「三綱淪矣！」居正益怒、嗾臺省劾之、以為昏耄、勒令致仕．
丙午、上戒諭羣臣曰：「奸臣小人、藐朕沖年、忌憚元輔．乃借綱常之說、肆為誣論．欲使朕孤立於上、得以任意自恣．茲已薄處、如或黨奸懷邪、必罪不宥．」時言奪情者得罪、都人士皆憤怒．作謗書懸長安門、謂居正且反．上聞之、故宣諭於朝、謗議稍息．已而召居正於平臺、慰諭甚至、即日入直．初、居正喪次、凡閣中事、令吏齎奏就擬處分．手詔稱元輔、稱太師、稱先生、皆盡古師臣之禮．
十一月癸丑朔、以星變考察羣臣．始張居正自矯飾、雖或任情、而英敏善斷、中外羣譽之、居正亦自負不世出．迨劉臺論居正得罪、志意漸恣．至是、益知天下不見與、思威權劫之矣．
令天下度田．國初、天下土田八百五十萬頃．至後漸減、歲久滋偽．豪民有田不賦、貧民曲輸為累．民窮逃亡、故額頓減．張居正請料田、凡莊田、民田、職田、蕩地、牧地、皆就疆理無有隱．其撓法者、下詔切責之．
六年春正月、將舉大婚、首輔張居正充納采問名副使．給事中李淶疏言：「居正有服制、不宜與執事、乞改命．」上不允．以聖母諭諭居正、遂從吉．
三月甲寅、張居正乞歸治葬、許之．辭朝、上召見於平臺、勞諭之曰：「朕不能捨先生、恐重傷先生懷、是以忍而允所請．雖然、國事至重、朕將焉依！」居正奏言：「皇上大婚之後、宜撙節愛養、留心萬機．」因伏地而哭．上亦為之哽咽墮淚、曰：「先生雖行、國事尚宜留心．」乃賜銀印、曰「帝賚忠良」、令得密封言事．進辭兩宮、各賜贐金、慰諭有加．
庚辰、遼東再奏大捷、上歸功張居正、使使馳諭、俾定爵賞以聞．召趣還朝、居正以母老、俟秋上道．命錦衣歸馳趣之．
六月乙未、張居正還朝、上召見於文華西室．問沿途所見、稼穡何如？民生何如？邊事何如？居正對甚悉．上大悅、賜休沐十日．
十二月、命纂《宗藩要例書》、頒示諸王．先是、世宗朝公族繁盛、國用困竭、以故頗加損抑．至是、居正等念諸藩裁削、非天子親親意、乃略舉事例未當者十一條、請敕禮官集議、著為令．諸藩於是感激親上、而厚薄親疏有體矣．
七年二月、上患疹、慈聖太后命僧於戒壇設法度眾．張居正上言：「戒壇奉皇祖之命、禁止至今．以當時僧眾數萬、恐生變敗俗也．今豈宜又開此端？聖躬違豫、惟告謝郊廟社稷、斯名正言順、神人胥悅、何必開戒壇而後為福哉！」事遂寢．
二月、河工成．先是、淮安有水患、河決入淮．淮勢不敵、淮揚咸為巨浸、直逼泗洲、患近陵寢．上以問張居正、因上言：「故河道都御史潘季馴可使．」乃降璽書、即其家拜都御史、使持節治河．一切假以便宜久任、帑藏不問出入．諸奉行不及事者、下詔獄鞫治之．於是當事者日夜焦勞、蓋踰年而隄成、轉漕無患．
三月、上疹愈、徵光祿寺十萬金．張居正上言：「財賦有限、費用無窮．使積貯空虛、不幸有四方水旱之災、疆埸意外之變、可為寒心．此後望力加撙節、若再徵金、臣等不敢奉詔矣．」時上漸備六宮、太倉所儲、屢有宣進．居正上戶部所進御覽錢糧數目、請置之坐隅、時賜省覽、量入為出．因言：「萬曆初年、所入四百三十五萬有奇．六年、所入僅三百五十五萬有奇、則已少八十餘萬矣．五年、歲出四百四十九萬有奇、則已多四十餘萬矣．夫歲出則浮於前、歲入則損於前、此不可不留心也．《王制》、量入為出、計三年之出、必有一年之餘而後可．況財用止有此數、設法巧取、不能增多．惟加意撙節、則用自足．」上嘉納之．
夏四月、上以內庫缺錢、賞賚不足、命部鑄大錢以進．張居正上言：「先朝鑄錢呈式、非供上用也．萬曆二年、進錢一千萬、其後歲半之、已非本意．若闕錢鑄進、是以外府之儲取供內府、大失舊制矣．」上從之、乃罷鑄錢．
癸卯、張居正上《肅雝殿箴》、命書於御屏．
五月、封遼東總兵李成梁為寧遠伯．張居正言：「成梁屢立戰功、忠勇為一時冠、加以顯秩、此鼓勵將士之法也．」已而成梁使使餽以金、居正曰：「而主以百戰得功勳、我受其金、是得罪高皇帝也．」卻不受．
七月甲子、給事顧九思、王道成等以江南水災、請罷浙、直織造內臣．上以示張居正、居正奏民重困、宜召還孫隆．上曰：「彼織幣且完、當俟來春耳．」居正曰：「地方多一事、則有一事之擾；寬一分、則受一分之惠．災地疲民、不堪催督、暫去之、俟稍稔可復也．」上從之．時給事中李淶請卹江南水災、并言四事．上怒其譏訕．居正曰：「水災請卹、亦言官之常．雖或觸忤、恐傷聖度．」上意乃解．
冬十月、薊遼總督梁夢龍報土蠻大舉入寇．張居正奏言：「臣諭邊臣、如敵騎入、勿輕戰、堅壁清野．野無所掠、彼將自阻．請令夢龍駐永平、戚繼光駐一片石．伺間邀擊．」上善之．既而土蠻以四萬騎犯前屯、梁夢龍、李成梁率兵禦卻之．
十二月、張居正服闋、召見於平臺．
八年春正月己未、先是、永豐梁汝元聚徒講學、吉水羅巽亦與之游．汝元揚言：「張居正專政、當入都頌言逐之．」居正微聞其語、授指有司捕治之．已、湖廣、貴州界獲妖人曾光、竄入汝元、巽姓名、云謀不軌．汝元、巽俱先死、湖廣守臣具爰書下法司訊之、并曾光亦非真也、第據律論罪．
三月、大學士張居正具疏乞休．再上、上慰留懇切．最後、手書傳慈聖口諭：「張先生受先帝付託、豈忍言去！俟輔爾至三十、卻再審處、讓後人非晚也．」居正因復就職．
甲子、賜進士張懋修等三百人及第、出身有差．懋修兄敬修、亦成進士、得禮部主事．俱居正子．
八月戊子、刑部侍郎劉一儒移書張居正曰：「竊聞論治功者貴精明、論治體者尚渾厚．自明公輔政、立省成之典、復久任之規、申考憲之條、嚴遲限之罰．大小臣工、鰓鰓奉職、治功既精明矣．愚所過慮者、政嚴則苛、法密則擾．今綜覈既詳、弊端剔盡．而督責復急、人情不堪、非所以培元氣而養敦渾之體也．昔臯陶以寬簡贊帝舜、姬公以惇大告成王、淪洽當代、矩矱後世、願明公法之．」居正得書不懌．
十一月戊寅、上以夜宴、惑於內侍孫海客等、撻二內使幾斃．慈聖太后聞之、切責上、令取《霍光傳》入覽．上悔悟、降孫海客等．明日、上諭閣臣：「朕在沖年、自多過愆、惟藉諸先生力諫、使朕為堯、舜之君．」張居正因奏：「諸內臣老成廉慎者存之、諂佞放恣者汰之．皇上亦宜痛改、戒宴飲以重起居、專精神以廣繼嗣、節賞賚以省浮費、卻玩好以定心志、親萬機以明庶政、勤講學以資治理、端趨向以肅士風、則聖德愈光矣．」上深嘉納之．
十二月甲辰、張居正請屬儒臣、以累朝《寶訓》、《實錄》、分四十餘則：曰創業艱難、曰勵精圖治、曰勤學、曰敬天、曰法祖、曰保民、曰謹祭祀、曰崇孝敬、曰端好尚、曰慎起居、曰戒遊佚、曰正宮闈、曰教儲貳、曰睦宗藩、曰親賢臣、曰去好邪、曰納諫、曰守法、曰敬戒、曰務實、曰正紀綱、曰審官、曰久任、曰重守令、曰馭近習、曰待外戚、曰重農、曰興教化、曰明賞罰、曰信詔令、曰謹名分、曰卻貢獻、曰慎賞賚、曰甘節儉、曰慎刑獄、曰褒功德、曰屏異端、曰飭武備、曰禦寇盜．仍敕次第進呈、俟明年開講．其諸司章奏切要者、即講畢面裁．時上留意翰墨、居正以為筆札小技、非君德治道所係、故有是請．上嘉納之．
九年春正月、大學士張居正請令翰林分番入直、應和文章．或令侍上清讌、質問經義、陳說治理、如唐、宋故事．
夏四月辛亥、上御文華殿、張居正以給事中傅作舟疏進覽云：「今江北淮、鳳及江南蘇、松連被災傷、民多乏食、至以樹皮充饑．或相聚為盜、大有可憂．」上曰：「淮、鳳頻年告災、何也？」居正對曰：「此地從來多荒少熟、元末之亂、皆起於此、今當破格賑之．」上曰：「然．」居正極言：「今有司負職、如積穀一事、屢旨申飭、竟成虛文．」上作色曰：「有司忽民、宜重處之．」居正曰：「以後犯者、當如聖諭．」又曰：「江南、北旱、河南風災、畿內不雨、勢將蠲賑．惟皇上量入為出、加意撙節．如宮費及服御、可減者減之、賞賚可裁者裁之．至若施捨緇黃、不如予吾赤子也．」上曰：「然．今宮費俱節、賞賚不溢．」居正曰：「皇上謂從舊、亦近例耳．如今年暫行、明年即為例、非祖制也．臣不敢遠引、如皇祖用度最繁、然內帑尚有餘積．隆慶初庫貯尚有餘萬、今歲入百二十萬、猶稱乏．惟皇上省察．」上是之．
十一月、張居正一品考滿、賜金幣及酒果甚厚．手敕褒諭、有「精忠大勳、言不能盡、官不能酬」之語．加上柱國、太師、支伯爵俸．居正固辭、允之．
十年二月丁酉、大學士張居正上言：「安民之道、在察其疾苦．今尚有一事為民害者、帶徵稅糧也．夫百姓財力有限、一歲之入、僅足供一歲．不幸歲歉、目前尚不能辨、豈復有餘力更完累歲積逋乎！有司避責、往往將今年所徵抵完舊逋．即今歲所欠、又為將來帶徵矣．況徵輸額緒繁多、年分淆雜、小民竭脂膏、胥吏飽谿壑．甚者、不肖有司因而漁獵．夫與其朘民以實奸貪之橐、孰若盡蠲以施曠蕩之恩？乞諭戶部、覈萬曆七年以前積負、悉行蠲免．將見年正額、責令盡完．在百姓易辦、在有司易徵、是官民兩利也．」上從之．詔下、中外大悅．
三月丁卯、張居正有疾、求私宅票擬．從之．六月甲午、居正以疾再乞休、不允．上以細務委張四維、大事即居正家平章．
以遼左大捷、斬速把孩功、進張居正太師．
甲辰、上遣司禮太監齎手敕諭張居正曰：「聞先生糜飲不進、朕心憂慮．國家大事、當一一為朕言之．」居正力疾疏謝、并上密奏、薦禮部尚書潘晟、吏部左侍郎余有丁．明日、上即命二人入閣．丙午、大學士張居正卒．上震悼輟朝、遣司禮太監張誠監護喪事、賜賻甚厚．兩宮太后及中宮、俱賜金幣．賜祭十六壇、贈上柱國、諡文忠．
居正性深沈機警、多智數．為史官時、嘗潛求國家典故、及時務之切要者者剖晰之、遇人多所諮詢．及攬大政、登首輔、慨然有任天下之志．勸上力行祖宗法度、上亦悉心聽納、十年來海內肅清．用李成梁、戚繼光、委以北邊、壤地千里、荒外讋服．南蠻累世負固者、次第遣將削平之．力籌富國、太倉粟可支十年、冏寺積金、至四百餘萬．成君德、抑近倖、嚴考成、覈名實、清郵傳、核地畝、一時治績炳然．惜其褊衷多忌、剛愎自用．初入政府、即以私憾廢遼王．久直信任、奸佞好諛成風．六曹之長、咸唯唯聽命．至章疏不敢斥名、第稱元輔．始譽以伊、周、漸進以五臣、且諛之舜、禹、居正亦恬然居之．而中允高啓愚至以「舜亦以命禹」題試士、當時目為勸進．居正卒、餘威尚在、言官奏事、尚稱先太師．方奪情時、威權震主．上雖虛己以聽、而內顧不堪．身死未幾、遂遭削奪、并籍其家、子孫皆不保云．初、上在講筵、讀《論語》「色勃如也」、誤讀作「背」字．居正忽從旁厲聲曰：「當作『勃』字．」上悚然而驚、同列皆失色．上由此憚之．及居正卒後蒙禍、時比之霍氏之驂乘．
御史郭維賢疏薦吳中行等降調、然上意已漸移．御史楊寅秋劾王國光．罷之．發馮保南京閒住．吳中行、趙用賢、艾穆、沈思孝、王用汲、余懋學、朱鴻謨、趙應元、傅應禎、趙世卿、鄒元標俱復官．會潞王昏禮、所需朱寶未備、太后間以為言．上曰：「辦此不難、年來廷臣無恥、盡獻張、馮二家耳．」太后曰：「已抄沒矣、必可得．」上曰：「保黠猾、盡竊而逃．」自此內中「張先生」、「張太岳」稱謂、絕以為諱．而籍沒之舉、亦胎於此．
十二年、上從遼府次妃王氏奏請、籍沒張居正家、其產不及嚴嵩二十分之一．株連頗多、荊、川騷動．上曰：「遼府廢革、既奉先帝宸斷、又無應繼之人、著推舉親枝、以本爵奉祀、仍準王歸葬．原封抱養子述璽、準依親居住、給興庶糧二百石、本折中半支．王氏從厚、援徽府例贍養．張居正誣蔑親藩、箝制言官、蔽塞朕聰．私占廢遼地畝、假以丈量遮飾、騷動海內．專權亂政、罔上負恩、謀國不忠．本當斵棺戮尸、念效勞有年、姑免盡法．伊屬張居易、張嗣修、張順、張書、俱令煙瘴地面充軍．」．
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