五月十九日，遼陽幼童間有習拳者；二十日，有人發賣灶神者。跡近於匪，州牧陳衍庶飭差拘詢，枷號示眾。比即出示嚴禁造言生事。自是市井稍靜。將軍增祺電詢：「地方安靜否？」陳牧覆信：「近日地方稍安，教路照常保護，請舒憲？」等語。增將軍亦覆云：「所言甚善。」
二十七八等日，市面忽喧傳天津拳匪獲勝之事，民間又復汹汹。耶穌教士來署，請派人保護教堂。陳牧立即派捕兵協同差役分往各教堂梭巡，並而諭其實力防護，如見形跡可疑者，即拘署訊辦。並語教士云：「此系游民造言惑眾，國家定能剿辦，無足為患。」教士云：「中國政府有與各國開戰之意，聞大沽業已失守。」陳牧聞之愕然，曰：「果然，則大局恐將決裂，閣下急宜速圖。設有不測，非一州縣官之力所能保全。力不從心，想閣下亦諒此情。」教士亦以為然。二十九，各耶穌教士均動身赴營口。本日，陳牧接增將軍劄發剿匪之諭，張貼告示，嚴禁謠言。
六月初一日，陳牧接副都統晉昌命，使即速備戰。午間去城十里之□□□□□教堂，陳牧正往勘視，突來哨弁二員，氣勢汹汹，且聲稱奉副都統面諭，特來焚毀鐵道教堂，自認尤莊子之事系伊所為。陳牧詰之曰：「此間連奉軍帥電諭，均云實力保護，今何又相反若此？且中外強弱不敵，人所共知，倘若無端開釁，何所恃而不恐？」該哨弁始猶強辯，終乃爽然若失。
陳牧遂一面會同城守尉，據情飛急電稟軍帥，速徹來兵以解俄人之疑，一面親赴城外火車站拜會俄員吉利時滿，力辯尤莊子之事實系亂民所為，決非官軍之事。俄人疑信參半，陳牧並力陳牧任保護之責。俄人頗悅，遂將其劫來尤莊子附近鄉民數十人交陳牧帶回。下午，天主教士致函陳牧，帶回員恩某，家中習練拳術。陳牧當即知會城守尉，約恩到署詰問此事，彼此爭論幾裂，嗣經城守尉大加申斥，恩始無言而去。少間，有晉昌所統育軍營官明來到遼拜見陳牧，細述都統派來之意，並云隨來兵丁三百餘名。該營官亦不以都統舉動為然，陳牧與之細談不能妄開兵釁之故，並囑其嚴約兵丁，不准出城滋生事端。只大臣赴反覆上游，亦為拳匪所惑，以為可操必勝之權，趕欲開釁。至晚間，聞都統已遣人前往各處張貼仇教告示。陳牧專人分往各城告知此事，並囑其加意防範。夜五鼓時，州署接增軍帥覆電云「該哨弁恐系冒名，路教仍須切實保護」等語。
陳牧見撤兵無期，恐與匪合，憂憤交迫，初二日，飛電通稟軍、副、學、尹、憲五部首道，詳述始末，力陳「中外不敵，斷難開釁，傳教本無厲禁，尤不可無端殺害，乞飛速調回來兵首事之人，從嚴懲治，則尤莊子之事尚可與俄人從容議了」等語，此稟約有八九百字。本夜有無數幼童，向耶穌教講書堂拋磚擲石，並有官兵從帝慫恿，令將該堂焚毀。陳牧馳至彈壓，匪人四散，得以無事。本日增軍帥接電後，約同五部各官與部統理論，爭鬧半日。夜間，始來電將兵調回。自是遼沈商民歡傳天津拳匪大勝，人心日益汹湧。
初五日，副都統晉昌親率兵拳攻打瀋陽各教堂，殺害西士數人，教民數百，搶劫洋貨店十餘家，揮刀切齒，舉國若狂。
以五部之貴，見必脫帽下車；以將軍之權，只得閉門束手。消息傳至遼陽，人思群起效尤。加之初八日各處喧傳開戰諭旨，匪勢愈張，如河決山崩，莫可抵禦矣。陳牧遂遣人勸法教士速乘俄火車赴營口，以避凶鋒，並由薩通事致意英國礦師莫里君，連夜逃脫，以防不測。
初九日，省城陸續派來兵拳毀路，仇教。是夜，遼陽各教堂均被焚毀。斯時寡不敵眾，欲救無從。陳牧竟將搶劫教堂衣物之匪，置之刑典。所幸各西士均先期逃去，尚未遇難。
初十日，省城又派來育軍四營，攻打城外白塔寺火車站。
至時匪民助戰者，頗有傷亡。陳牧諭人，指此為邪匪不足避槍炮之證。因此拳匪聞之，蜂擁州署，刀劍橫飛，直逼內堂。陳牧計窮力竭，性命幾危。約在初十日內外，聞城中有教民某姓被害。陳牧馳往救援，已無及矣。於是陳牧稟請增將軍設權宜之計，刊刻出教保護執照，發給教民，因此活命者有千餘人。
故教民感激州官不置。
七月中，新民廳三台子地方，教堂聚集教民數百，省城義和拳大臣派兵往剿，陳牧電阻數次，力持宜撫解不宜攻擊之意。
因此前敵將士頗與反目，拳匪尤為譁然。
至七月十九日海城失守，拳匪始稍稍斂跡。至八月初，遼沈相繼失守，拳匪絕跡，而大局亦不救矣。
