蒙哥，也就是后来的宪宗桓肃皇帝，是拖雷的长子，他母亲是显懿庄圣皇后，客烈亦氏。蒙哥出生在太祖三年，一个懂天象的晃忽答部人说他将来会大富大贵，所以给他取名蒙哥，意思是长生。他小时候，成吉思汗还在当皇子的时候，就把他当成自己的孩子养着，还让自己的两位皇后抚养他。他父亲拖雷去世后，蒙哥才被封到自己的封地。
成吉思汗的儿子窝阔台当皇帝的第七年，蒙哥跟着拔都去征讨奇卜察克和斡罗思等部族。第九年，他们攻打奇卜察克，一个叫八赤蛮的酋长逃跑了，躲在浮而嘎河的树林里。蒙哥带兵进林搜捕，只看到一个空营帐里有个生病的老妇人。问她八赤蛮在哪儿，老妇人说八赤蛮已经逃到宽田吉思海岛了。当时北风很大，海的北岸水比较浅，蒙哥就带兵渡海，出其不意地抓住了八赤蛮。蒙哥命令八赤蛮下跪，八赤蛮说：“我是一个国家的主子，怎么会想着苟且偷生呢？再说我又不是骆驼，为什么要下跪？”蒙哥把他关了起来，八赤蛮对看守的人说：“我躲在海岛上，跟鱼有什么区别？但是最终还是被抓住了，这是天意。现在水位上涨的时间快到了，你们应该赶紧回去。”看守的人把这话告诉了蒙哥，蒙哥当天就下令军队撤退，结果水真的涨上来了，后方的军队差点没渡过河。八赤蛮请求蒙哥赐他一死，蒙哥就命令他的弟弟拨绰把他杀了。
后来，蒙哥又和拔都一起攻打斡罗斯的勒冶赞城，蒙哥亲自上阵搏斗，最终攻下了这座城池。窝阔台十一年春天，蒙哥又和贵由一起攻打阿速的蔑怯思城。十二年，他们围攻斡罗斯的计掖甫城，蒙哥派使者去劝降，城里的人杀了使者，蒙哥大怒，日夜猛攻，最终攻破了城池，把城里的人全部杀光了。窝阔台死了以后，军队都往东撤，贵由继位，命令蒙哥驻扎在六盘山，控制秦陇地区，为将来攻打蜀地做准备。贵由死后，他的皇后斡兀立海迷失临朝称制，拔都和其他的王子们在阿勒塔克山开会，商议立谁为新皇帝。贵由的皇后派使者帖木儿去参加会议，参加会议的有西方的诸王忽必烈、阿里不哥、末哥，东方的诸王也孙格、塔察儿、帖木迭儿、也速不花，还有大将兀良合台、速你带、忙哥撒儿等人。这时，大将野里知吉带从西域赶来，建议按照成吉思汗的遗命立失烈门为汗。
蒙哥的弟弟忽必烈站起来反驳说：“成吉思汗确实想立失烈门，但是你们当初辅佐贵由继位，这又算怎么回事呢？阿克塔隆是成吉思汗的女儿，即使她有罪，也应该召集诸王和哈屯们一起审判，而不是不问青红皂白就杀了她，这又哪里是成吉思汗和窝阔台的做法呢？今天的事情，怎么能拿成吉思汗的遗命当借口呢？” 听到这话，大家都说不出话来了。
当初成吉思汗把部众分给他的子孙，因为拖雷比较年轻，所以分到的比较多，因此很多将领都是拖雷的旧部。拖雷死后，蒙哥和他的兄弟们年纪还小，所有的事情都是由庄圣皇后决定的。皇后很有才能，能够驾驭众人，而且和拔都关系也很好，所以大家都拥护蒙哥。当时有人建议，拔都年纪最大，应该由他当汗。拔都不同意，大家就说：“既然您不愿意自己当汗，请您帮我们选一个人，好定下大事。”拔都说：“我们国家疆域辽阔，只有聪明睿智，能够效法成吉思汗的人才能当汗。我认为蒙哥合适。”大家纷纷表示赞同。蒙哥坚决推辞，他的弟弟末哥说：“大家都认为拔都说的对，现在为什么又不听了呢？”拔都说：“末哥说的对。”就这样，大家决定立蒙哥为汗。皇后又派使者告诉拔都，说会议应该在东方举行，不应该在西方，而且诸王还没到齐，不能轻易决定。拔都说：“成吉思汗和窝阔台的大业不能轻易交给别人，现在汗位已经确定了，我愿意顺从。明年我们再在东方会面吧。”然后，他派他的弟弟伯勒克和脱哈帖木儿率领大军护送蒙哥往东，他自己则留在西方以防万一。
1271年春天，很多王爷和将军在阔帖兀阿兰集合开会，但是太宗、定宗的几个儿子，还有察合台的儿子也速蒙哥都没来。拔都派人去劝他们，他们还是不来。于是伯勒克他们就去找拔都，拔都就下令，谁要是敢捣乱就按国法处置。西边的王爷别儿哥、脱哈帖木儿，东边的王爷也古、脱忽、也孙格、按只带、塔察儿、也速不花，还有西边的大将班里赤等等都来了，然后就选了个日子，举行登基大典。
六月，皇帝在斡难河和克鲁伦河之间登基，追尊他爹拖雷为皇帝，尊客烈亦氏为皇太后。登基那天，王爷们站在右边，公主们站在左边，七个弟弟站在前面，文官以孛尔该为首，武官以忙哥撒儿为首，仪式很隆重，之后大摆宴席，庆祝了七天。
过了几天，御前侍卫克薛杰报告说发现有人要造反，自己追出去了。他看到好多车马，一辆车轴断了，误以为克薛杰是同行的人，就让他帮忙绑车轴。结果克薛杰看到车里藏着兵器，就问怎么回事，那侍卫说：“你的车里也是这样，你问什么？”克薛杰又问了其他车，这才知道失烈门、忽察、脑忽这三个王爷想趁着宴会闹事。皇帝把这事儿瞒了下来，命令忙哥撒儿带兵去堵住这三个王爷，每个王爷身边只留了二十个卫兵，献上九白贡品。第二天，皇帝亲自审问失烈门他们，他们都不承认。后来审问失烈门的属下，属下才说出了实情，然后自杀了。皇帝又让忙哥撒儿彻查失烈门他们的同伙，太祖的功臣也孙帖额、掌吉、爪难、合答曲怜、阿里出等等，还有野里知吉带的两个儿子，都被处死了，一共七十多人。
也速蒙哥、不里这俩王爷后来也没来，皇帝就派大将卜怜吉带兵防着他们。然后皇帝开始改革各种政务：让弟弟忽必烈负责漠南地区的军队和百姓，在金莲川设立府邸；任命忙哥撒儿为断事官；任命孛尔该为大必阇赤，负责发布命令、接受朝贡和处理内外奏章；让晃忽儿留守和林，阿兰答儿协助他；任命牙剌瓦赤、卜只儿、斡鲁不、睹答儿等人负责燕京等地的行尚书省事务，赛典赤、匿昝马丁协助他们；任命讷怀、塔剌海、麻速忽等人负责别失八里等地的行尚书省事务，暗都剌兀尊、阿合马、也的沙协助他们；任命阿儿浑负责阿母河等地的行尚书省事务，法合鲁丁、匿只马丁协助他们；让察罕、也柳干统领两淮地区的蒙古汉军，让带答儿统领四川地区的蒙古汉军，让和里统领吐蕃地区的蒙古汉军，他们都继续负责之前的征讨任务；封克薛杰为答剌罕；让僧海云负责佛教事务，让道士李真常负责道教事务。
皇帝还颁布了一些便民措施：朝廷和王爷们乱发的印信和诏令都收缴了；王爷们骑马出行，最多只能骑三匹马，长途旅行也不超过四匹；王爷们不能随便招募百姓；官员们不能以朝觐的名义向百姓收钱；交粮可以就近交；停建和林城的徭役，减少五千人；按照太祖太宗的旧例，免除老年人和佛教道教徒的丁税，只有犹太教不在此例；修改了西域的税则，牛马一百头收税一头，不满一百头的免税；替定宗、皇后和皇子偿还欠商人的五十万锭银子。
秋天，察罕来朝见，皇帝任命他为都元帅，兼领尚书省事务。十一月，弟弟忽必烈来朝见，皇帝听说西夏人高智耀很有名，就召见了他，根据高智耀的建议，免除了全国儒士的徭役，没再做什么其他的安排。这年冬天，在八脱吉斯抓到了野里知吉带，皇帝命令拔都处死了他。任命僧那摩为国师，负责全国的佛教事务。
公元1260年春天正月，皇帝跑到失灰之地去玩儿了。他命令皇弟旭烈兀去打木剌夷，还让乃蛮人怯的不花当先锋。这时候，皇太后客烈亦氏去世了。朝廷在汴京设立了经略司，任命忙哥、史天泽、杨惟中、赵璧等人当经略使，让他们在唐州、邓州等地屯田。
二月，察罕攻打宋朝的随州、郢州、安州、复州等地，跟宋朝大将马荣在大脊山打了一仗。三月，皇帝命令东平万户严忠济负责制定冠冕、法服、钟磬、仪仗的规格，并组织人练习使用。四月，皇帝在和林驻跸。定宗皇后的母亲斡兀立海迷失和失烈门母亲因为搞厌禳（古代迷信活动）的事情败露了，皇帝下令让忙哥撒儿审问，结果查实了，两人都被赐死了。因为忽察、脑忽、失烈门这三个王爷都是受他们母亲唆使的，所以免了他们的死罪，但是把忽察发配到苏里该，把脑忽和失烈门发配到没脱赤，并在军中软禁了和只、纳忽、孙脱等人。
皇帝还给太宗的子孙们分了地盘：合丹住在别失八里，蔑里住在也儿帖石河，海都住在海押立，别里哥住在曲儿只，脱脱住在叶密立，蒙哥都和太宗皇后乞里吉忽帖尼住在阔端太子分地西边。同时，把太宗皇后和其他妃子的财产分给了诸王。皇帝还派贝剌去察合台的封地，逮捕那些违抗命令的大臣；像乞儿吉思、谦谦州等地，都派兵去巡查。皇帝下令让察合台的孙子忽剌旭烈杀了也速蒙哥，让他继承王位。结果忽剌旭烈还没到就死了，他的妻子倭耳千纳杀了也速蒙哥，自己当了摄政王。皇帝把太宗的儿子不里交给海都，结果不里被海都杀了。定宗时期当权的大臣喀达克等人也被处死了。
六月，皇弟忽必烈来朝见皇帝。七月，皇帝命令忽必烈去征讨大理，又命令塔塔儿台、撒里、秃儿花撒去征讨印度。皇帝还下诏书，命令宋朝荆南、襄阳、樊城、均州等地的守将投降。八月庚申日，皇帝穿着冕服在日月山祭天。八月癸亥日，皇帝采纳孔元措的建议，同时祭祀昊天和后土，还制作了神牌，把太祖和睿宗一起供奉。这个月，忽必烈到了临洮，请求攻打利州，因为他认为利州是攻取蜀地的关键。十月，汪德臣率兵袭击了宋朝的成都，又进攻嘉定，结果被宋朝大将余玠打败了。皇帝命令诸王也古去讨伐高丽。皇帝在月帖古忽兰打猎的时候，从马上摔下来伤了胳膊，因此一百多天没有上朝。十二月戊午日，皇帝下令大赦天下。同时，任命帖哥出、阔阔朮等人掌管国库；孛阑合剌孙掌管斡脱；阿剌忽掌管祭祀、医巫、卜筮，阿剌不花当他的副手；只儿斡带掌管驿站。皇帝还把五百户工匠迁到修行宫。这一年，朝廷在汉地进行了户口登记。印度还派使者来进贡。
公元1260年春天正月，汪德臣攻下了利州和阆州，然后分兵屯田，宋朝军队根本不敢越界侵犯。这时，忽必烈皇帝在怯蹇察罕一带打猎。也古王怀恨在心，袭击了塔察儿王的营地，皇帝于是就在斡难河北召集诸王开会，取消了也古王率军攻打高丽的计划，并任命札剌儿为征东元帅。同时，皇帝还派必阇赤别儿哥去括斡罗思统计户口。这一年，皇帝大规模封赏同姓宗亲，命令皇弟忽必烈在河南和陕西两地选择一个作为封地，忽必烈选择了陕西，于是就得到了京兆府的一部分土地。
三月，察罕攻打宋朝的海州，在城下打败了宋将王国昌，还俘虏了一个都统。六月，皇帝命令兀良合台跟随皇弟忽必烈去征讨大理，又命令皇弟旭烈兀去征讨报达。同时，还命令撒里等人去征讨印度的斯单克什米尔地区，并受旭烈兀节度。撒里等人从克什米尔进入印度斯单境内，大肆劫掠一番后返回。皇帝来到了火儿忽纳要不儿的地方巡幸。拔都王派使者来请求购买一万锭珠银，皇帝赏赐给他一千锭，并告诫他说：“太祖、太宗留下的钱财就是这样用的，怎么够给诸王赏赐呢？你应该好好考虑一下，这批银子就当做你今年的赏赐吧。”
秋天八月，皇帝巡幸到了军脑儿。皇帝任命忙哥撒儿为万户，哈丹为札鲁花赤。九月，忽必烈到达忒剌，分兵三路进攻，兀良哈台走西路，也只烈王走东路，忽必烈自己走中路。冬天十月，忽必烈渡过了金沙江，摩挲蛮酋唆火鲁前来投降。十二月，忽必烈攻入大理。皇帝则巡幸到了汪古部。皇帝命令也古王和洪福源一起征讨高丽，攻克了禾山、东州、春州等城池。这一年，怯的不花入侵了苦亦斯单，一直打到塔密干，攻打吉儿都苦堡，木剌夷酋长派兵前来救援。忙哥撒儿去世了。忙哥撒儿为人严厉，很多人对他有怨言，皇帝为此下诏安慰他的儿子。
公元1264年（至元元年）二月，宋朝将领余晦攻打紫金山，结果被汪德臣打得大败，丢了城池。三月，宋朝派来的使臣王元善回国了。这期间，皇帝在怯蹇察罕的地方打猎。夏天，皇帝在月儿灭怯土驻扎，札剌儿带回到军中，也古罢回了老家。七月，朝廷下令让官吏们到朝廷来结算钱粮，允许那些有不公行为的主动坦白，同时禁止以后再浮报费用。兀良合台攻打乌蛮赤押城，把城池攻下来了。大理酋长段智兴投降了。八月，皇弟忽必烈从大理回来，驻扎在桓州和抚州。十一月，攻下了光化军。皇帝又在也灭千哈理察海的地方大肆打猎。这一年，皇帝在颗颗脑儿西边召集诸王祭天，地点在日月山。同时，还开始登记新兵。皇帝命令大臣们寻找那些能够谨慎稳固地防守，并且精通兵法的将领。于是提拔史枢为征行万户，给他配上真定、相州、卫州、怀州、孟州的军队，让他驻扎在唐州和邓州。张柔调到亳州驻扎，并且从亳州修筑道路连接汴堤，方便商贾通行。朝廷下令让张柔率领山前八军攻打亳州。宋朝均州总管孙嗣宗派人送来蜡书请求投降，皇帝就命令万户史权率领精兵前去支援。宋朝的骁将钟显、王梅、杜柔、袁师信都带着自己的部队投降了。
公元1265年（至元二年）春天，确定了汉民的各项赋税包银数额，每户征收四两银子，其中一半用银子缴纳，另一半可以用丝绸、绢帛、颜料等物品折抵。夏天，皇帝又驻扎在月儿灭怯土。九月，张柔与都元帅察罕在符离会合，修筑了横江堡，并且设置了水栅，打通了陈州、蔡州、颍州、息州之间的道路。这一年，史枢在汉水的鸳鸯滩打败了宋军的船队。兀良合台攻打鲁鲁厮、阿伯等部族，这些部族都投降了。朝廷重新任命札剌儿带和洪福源去征讨高丽。马步军都元帅兼领尚书省事察罕去世了。真定等路万户史天安也去世了。
话说公元1262年正月，元世祖忽必烈在月儿灭怯土（地名）召集了所有王子和百官，摆了六十多天的盛大宴会，赏赐了金银财帛，还顺便确定了以后每年给各位王子的赏赐数额。忽必烈还提议继续招募内地汉军，皇帝就同意了。
到了四月，皇帝在答密儿（地名）驻扎。五月，又去了昔剌斡鲁朵（地名）。六月，居然发生了白天也能看见太白星的奇观！之后，皇帝又到了亦儿阿塔（地名）。这时，诸王也孙格和驸马也速儿等人建议讨伐南宋，因为南宋当年囚禁了他们的使者月里麻思，这件事已经拖了十六年，从太宗时期就开始了。
七月，诸王塔察儿和驸马帖里该率领部队路过东平，竟然抢掠了百姓的羊和猪！皇帝听说后，立刻派人调查他们的罪行，这才让军队收敛了一些，不敢再随意侵犯百姓了。冬天，皇帝驻扎在阿塔哈帖乞儿蛮（地名）。皇帝把阿母河地区的回回（回族）降户分给了各位王子和大将。
旭烈兀带着怯的不花、布帖木儿等人分三路大军进攻，木剌夷（地名）的首领兀克乃丁前来投降。但是，皇帝觉得木剌夷人太凶悍，下令旭烈兀把他们全部杀掉，就连前来朝贡的兀克乃丁也在半路上被杀了。十二月，元军攻下了枣阳。这一年，大理的酋长段智兴和素丹（地名）的一些部落首领都来朝见皇帝。兀良合台平定了乌白蛮三十七个部落，从昔八儿（地名）回到重庆，还打败了宋将张实。皇帝赏赐兀良合台一件金缕织文衣，五千两银子，以及两万四千匹彩帛给他的士兵们。最后，还在桓州东泺水北的龙冈（地名）开始修建城郭宫室。
公元1264年春天，元世祖忽必烈到忽兰也儿吉地方视察。他下令诸王出兵攻打南宋。同时任命阿蓝答儿在京兆府处理政务，刘太平协助他，一起审查陕西各路州府的财政赋税情况。忽必烈的弟弟忽必烈强烈要求带着他的妻子来朝见皇上。 董文蔚攻打南宋的襄阳和樊城，在白河和宋将高达到发生激烈的战斗。
六月，元世祖去祭拜太祖的行宫，祭祀了军旗和战鼓，又在怯绿怜地方召集诸王开会，之后回到月儿灭怯土。兀良合台建议效仿汉朝的制度，把西南地区的夷族都设置成郡县，皇上同意了。于是任命刘时中为宣抚使，同时提升兀良合台为大元帅，让他回大理镇守。秋天，元世祖在军脑儿驻扎，用马奶祭天。九月，元世祖把驸马纳陈的儿子乞封为达鲁花赤，派他镇守斡罗思，还赏赐给他三百匹马、五千只羊。回鹘进贡了水晶盆、珍珠伞等珍宝，价值三万多锭银子，皇上说：“现在老百姓都穷困潦倒，最需要的是钱，我独自拥有这些东西有什么用呢！”于是下令拒绝了这些贡品。赛典赤从中劝说，皇上才稍微补偿了一点贡品的价值，并下令禁止回鹘再次进贡。
诸王塔察儿率领军队攻打南宋，包围了樊城，可是碰上了连续几个月的暴雨，只好撤兵回去了。十一月，兀良合台攻打安南，攻入了安南的都城，安南国王陈日煚逃到了海岛上，兀良合台打了胜仗后凯旋而归。十二月，元世祖渡过漠南，驻扎在玉龙栈赤。他的弟弟忽必烈、阿里不哥以及诸王八里土、玉龙塔失、昔烈吉、出木哈儿、还有公主脱灭千都来迎接他。元世祖见到忽必烈，两人相对而泣，什么话也没说就结束了会面。这年冬天，他的弟弟旭烈兀派人来报捷，说已经攻克了伊利汗国的首都——巴格达。
公元1276年正月初一，忽必烈在也里本朵哈视察，接受了各地的朝贺。二月，南宋皇帝陈日煚把皇位传给了他的长子赵昺，并派阮学士带着贡品来进贡，兀良合台把贡品送到忽必烈的行宫。与此同时，旭烈兀传来捷报，说他已经击败并杀死了哈里发木司塔辛，并派使者来报喜。忽必烈在也里海牙打猎。之后，忽必烈亲自率军伐宋，留下阿里不哥留守和林，阿兰答儿辅佐他。他命令张柔跟随忽必烈攻打鄂州，然后直逼临安；命令塔察儿攻打荆山，以分散宋军的兵力。他还命令兀良合台从云南进兵，与其他部队在鄂州会合。纽邻在灵泉山击败了宋军，攻克了云顶山堡，成都府下属的彭州、汉州、怀安州、绵州等州以及威茂等地的土司纷纷投降，忽必烈任命纽邻为都元帅。忽必烈自己则从东胜渡过黄河。他还命令参知政事刘太平统计兴元府的人口。高丽的质子王綧诬告洪福源，忽必烈召见洪福源后将其处死。
四月，忽必烈在六盘山驻扎，召见了各路官员。丰州千户郭燧请求修筑金州城，忽必烈准许了。当时，忽必烈共有四万大军，对外宣称十万，分三路进攻：忽必烈自己率领大军从陇州进入大散关，诸王末哥从洋州进入米仓关，孛里察万户从渔关进入沔州。忽必烈任命明安答儿为太傅，镇守京兆。忽必烈下令征调益都行省李璮的军队，李璮奏报说益都南北都是重要的战略要地，军队不能撤走，忽必烈同意了他的请求。五月，皇子阿速带打猎时损坏了百姓的庄稼，忽必烈责备了他，并惩罚了他的几个近侍；有个士兵拔了百姓的葱，被斩首示众，因此大军所到之处秋毫无犯。七月，忽必烈把辎重留在六盘山，亲自率领大军从宝鸡出发，攻打重贵山，战无不胜。八月辛丑日，李璮在涟水与宋军作战，大获全胜。九月，忽必烈到达汉中。
纽邻率领军队渡过马湖江，俘虏了宋将张实，并派张实去招降苦竹隘，张实进入城内与宋将杨立一起坚守。行北京七路兵马都元帅府事史天祥去世。十月壬午日，忽必烈到达宝峰。癸未日，忽必烈到达利州，看到利州的城防薄弱，认为汪德臣能够守住，便赐给他美酒以示鼓励。随后，忽必烈渡过嘉陵江，到达白水江，命令汪德臣建造浮桥以便军队通行。军队进至剑门。戊子日，忽必烈派史枢攻打苦竹隘，宋军裨将赵仲打开城门投降，忽必烈赐给他衣帽，并将他迁到重庆。己亥日，忽必烈俘获张实并将其处死。忽必烈赐给汪德臣玉带，并留下五百精兵让他防守利州。忽必烈还派使者招降龙州。忽必烈在高峰驻扎。庚子日，忽必烈包围长宁山，守将王佐等人出战，被击败。十一月己酉日，忽必烈督促各路军队先攻打鹅顶堡。壬子日，忽必烈与宋军在望春门交战，击败了宋军，宋知县王仲投降。当夜，鹅顶堡被攻克，忽必烈任命彭天祥为达鲁花赤镇守。诸王末哥、塔察儿等人收复失地后，都率军前来会合。丙辰日，忽必烈进攻大获山，派王仲去招降守将杨大渊，杨大渊杀死了王仲，忽必烈大怒，督促各路军队猛攻，杨大渊最终投降，被任命为都元帅。庚午日，忽必烈在和溪口驻扎。这个月，宋朝的龙州投降。十二月，杨大渊和汪德臣分兵攻打相如等县。纽邻攻打简州，未能攻克。乙酉日，忽必烈到达运山。宋守将张大悦投降。军队进至青居山，宋军裨将刘渊等人杀死都统段元鉴后投降。丁酉日，隆州投降。己亥日，大良山守将蒲元圭投降。忽必烈下令军队不得抢掠。癸卯日，忽必烈攻克雅州，石泉山守将赵顺投降。甲辰日，忽必烈派降将晋国宝去招降合州守将王坚，王坚坚守不出。这一年，兀良合台在宋朝内地作战，接连攻克静江府、辰州、沅州等地，并包围了潭州。皇子辨都去世。
公元1369年正月初一，朱元璋在重贵山北驻扎，摆酒宴请群臣，问大家：“现在咱们在敌人的地盘上，马上就要天热了，你们觉得还能待下去吗？”脱欢说：“南方湿热多瘴气，皇上还是早点回吧，新俘获的人口，交给官吏管理就行了。”八里赤马上说：“脱欢这是胆小，让我来守！”朱元璋觉得八里赤说得对。 戊申日（正月初五），晋国宝退回峡口，被王坚追杀。诸王末哥进攻渠州礼义山，曳剌秃鲁雄攻打巴州平梁山。丁卯日（正月初八），杨大渊攻打合州，俘虏了八万多人。这个月，大军攻克了利州、隆庆、顺庆等府，蓬安、阆中、广安的守将相继投降。朱元璋命令浑都海率领两万兵马驻守六盘山，乞台不花驻守青居山。纽邻在涪州蔺市造了浮桥，以切断宋军的援兵之路。
二月初七，朱元璋从鸡瓜滩渡过长江，直接到达合州城下。二月十二日，攻打一字城。二月十四日，攻打镇西门。三月里，又攻打东新门、奇胜门和镇西门附近的几个堡垒。四月初七，下了二十多天的大雷雨。四月十一日，攻打护国门，宋将吕文德率领上千艘战船逆嘉陵江而上，结果被史天泽打败了。六月初四，汪德臣挑选敢死队夜里攀登外城，结果遇上大雨，云梯都被冲坏了，后军没能跟上，只好停止进攻。当天，汪德臣因病去世。朱元璋也开始身体不适。
七月，留下三千兵马围困合州，其余大军全部去攻打重庆。七月二十九日，朱元璋在钓鱼山去世，享年五十二岁。史天泽等人护送灵柩北返，葬在起辇谷。庙号宪宗，追谥为桓肃皇帝。朱元璋为人沉稳少言，不喜欢铺张浪费。太宗时期，群臣擅权，政令混乱，到了朱元璋这里，所有诏令都必须是他亲笔书写，反复修改好几次才能下发，对群臣管得很严。他还经常告诫左右的人说：“你们要是因为得到我的赏识就骄傲自满，那灾祸很快就会降临！你们一定要引以为戒！” 然而，他却迷信巫师、占卜和算命，凡事都要先问卜，一天也不例外，始终乐此不疲。
史学家说啊，宪宗皇帝聪明果断，在国内勤于政事，对外开拓疆土，亲自统领军队，驻扎在坚固的城池之下。虽然上天还没厌倦宋朝，但他却带着遗憾去世了，这确实是一位了不起的英明君主啊！
但是呢，皇帝天性冷酷薄情，猜忌自己的兄弟骨肉。那些被赦免的烈门诸王，后来又被杀害了。拉施特（一位历史学家）就说过，蒙古的内乱，就是从这时候开始萌芽的，破坏了成吉思汗睦族巩固根本的教诲。唉，说得真对啊！
