魏学曾，字惟贯，是陕西泾阳人，嘉靖三十二年考中了进士。一开始在户部当个主事，后来升了郎中。当时有个太监为了商人求情，想支取巨额的粮草款项，魏学曾坚决反对，这才作罢。没多久，他又升了光禄寺少卿，然后又升任右佥都御史，去辽东巡抚。
隆庆初年，土匪蛮族大举入侵永平。魏学曾亲自前往山海关驻守，下令诸将王治道等人追击，在义院口打了个大胜仗。之后，他又升任右副都御史。魏学曾上任后，马上调整将领和官员，招降纳叛，整理屯田，恢复了两千多顷的农田，多次打败敌人，因此获得了朝廷的赏赐。后来因为生病，他就告假回家了。
过了段时间，他又被起用为兵部右侍郎，负责督察神枢营。没过多久，他又调到吏部，升任左侍郎。穆宗皇帝驾崩后，大学士高拱想把冯保弄下去，就让言官们弹劾他。魏学曾给大学士张居正写信说：“外面都说你和冯保有勾结，遗诏也是你写的。现在这种情况，不应该再护着这个阉宦了。”张居正一听这话，可生气了。后来高拱被罢免了，朝中大臣都吓得脸色发白，只有魏学曾大声说道：“皇上刚登基就罢免顾命大臣，而且遗诏是谁下的，必须向百官说明白！”他要求各位大臣一起去张居正家理论。但很多大臣都不肯去，张居正也称病推辞。从那以后，魏学曾就更得罪张居正了。
后来，魏学曾被外放到南京当右都御史。还没上任呢，给事中宗弘暹就听张居正的指示弹劾他。最后，朝廷下旨让他以原官职候调，魏学曾只好回家了。张居正死后一年多，魏学曾又被起用为南京户部右侍郎。后来他又被召回朝廷，任命为右都御史，负责督察仓场。最后，他以南京户部尚书的职位告老还乡。
1690年，顺义王手下的将领撦力克带着兵马跑到青海去了，火落赤、真相这两个家伙也跑到洮河那边闹事，结果副总兵李奎、李联芳都被他们给杀了。朝廷就派尚书郑洛去负责七镇的军事，还让他兼任总督，但郑洛坚决不当这个总督。
第二年春天，内阁大臣王锡爵推荐了学曾，让他当兵部尚书，负责陕西、延安、宁夏、甘肃的军事。当时郑洛一心只想跟那些叛军讲和，学曾来了之后，两个人意见不合，陕西巡抚叶梦熊还帮着郑洛。一开始，顺义王被封王的时候，叶梦熊因为劝谏而得罪了人，学曾也因为高拱说过这事不妥当而受牵连。现在撦力克又帮着叛军造反，学曾和叶梦熊就想要彻底收拾他们，还说郑洛纵容敌人。
碰巧撦力克又回去了，火落赤他们那些部落也搬走了，学曾上奏说，虽然撦力克回去了，但他暗地里在嘉峪关留了两万精兵，想帮火落赤和真相。这些话都是他从路上听来的小道消息，结果朝中大臣都跟着起哄附和。王锡爵后悔了，写了奏章说明情况，还写信责备叶梦熊。但是兵部尚书石星觉得顺义王已经回去了，宣府那边的事更紧急，就召郑洛回来商量对策，把学曾的奏章直接晾在一边不管了。
没过多久，河套地区的部落首领土昧明安来赶集，想要朝廷多赏赐一些东西。学曾就命令总兵官杜桐、神木参将张刚、孤山游击李绍祖出其不意地把明安给杀了，俘虏了480多人，缴获了大量的马匹、牲畜和武器装备。学曾因为这次战功被加封为太子少保。可是明安的儿子摆言却大喊着要报仇，号召各个部落一起反抗。
明年，哱拜造反了，他就煽动各个部落一起闹事。这哱拜，是西部人。嘉靖年间，他得罪了他的部落首领，他爹他哥都被杀了，他侥幸逃脱投降了朝廷，因为骁勇善战，屡立战功。之前的巡抚王崇古、石茂华都上奏朝廷，给他加官，升到了副总兵，所以他就收留了很多亡命之徒。他儿子叫哱承恩，据说哱拜做梦梦见妖物进了他老婆的肚子，然后生下了承恩，这孩子长得像狼，叫声像猫头鹰，性情极其凶狠。哱拜老了以后，承恩就继承了他爹的爵位。
十九年，洮州和河州告急，御史周弘禴就举荐了哱承恩，还有指挥使土文秀、哱拜的义子哱云等人。巡抚党馨就下令让土文秀往西边去支援，哱拜就跑去见经略郑洛，说自己愿意和儿子哱承恩一起出征。党馨讨厌他主动请缨的样子，就故意打压他，哱拜因此心里就更怨恨了。到了金城，他发现各镇的军队都比不上他的兵强。等到叛军退了，哱拜就从塞外回来，路上碰到的敌人骑兵都吓得四处逃散，他就更加轻视朝廷军队了。党馨多次批评哱拜，还因为哱承恩犯了罪，打了二十板子，哱云、土文秀也因为别的原因怨恨党馨。
正好当时驻军士兵请求发放衣粮很久都没得到解决，哱拜就唆使他的手下刘东旸、许朝造反。二十年三月，他们杀了党馨和副使石继芳，逼着总兵官张维忠上吊自杀了。哱云、土文秀杀了游击梁琦、守备马承光，刘东旸自称总兵，奉哱拜为军师，哱承恩、许朝做了左右副总兵，哱云、土文秀做了左右参将。哱承恩接着就攻陷了玉泉营、中卫、广武，河西地区的人听到消息都吓坏了。只有土文秀攻打平虏的时候，参将萧如薰死守城池，没有失陷。叛军攻下了河西四十七个堡垒，还渡过了黄河，又勾结河套地区的著力兔、宰僧一起攻打平虏、花马池。整个陕西都震动了。
老上司曾下令，让副总兵李昫带着游击吴显去灵州，另外派游击赵武去鸣沙州，沿着黄河堵住敌人往南过河的路，他自己则驻扎在花马池，防备敌人的进攻。李昫他们过了河，好多敌将都逃跑了，四十七个堡垒都收复了，就只有宁夏镇城还在敌人手里。
这时候，贼寇首领力兔他们内外互相呼应，拜、文秀在玉泉袭击了赵武。云引带着力兔攻打平虏，结果如薰设下埋伏，射杀了云。李昫去救赵武，包围也就解除了。四月，李昫带兵和以前的总兵牛秉忠一起到了镇城下。皇上已经提拔董一奎当总兵，李蕡当副将，后来又提拔如薰代替董一奎，让麻贵代替李蕡。新任总兵副将还没到，李昫他们就开始攻城了。敌人从东西两个城门各派三千骑兵出来拼死搏斗，步兵则摆成车阵做营垒。官兵跟他们打，夺了他们一百辆车，追着他们跑进了湖里，淹死的敌人数不清。副总兵王通打得特别卖力。他的家丁高益他们乘胜追击，从北门进去了，可是后来援兵没跟上，高益他们都被杀了，王通也受了伤，榆林游击俞尚德战死了。
第二天，拜、文秀挟持着庆王上了东城，请求暂时停战，还骗说愿意献出首恶。正好官兵粮草也用完了，就撤退了，在附近的堡垒里休整。
老学曾那段时间可忙了，天天都在忙着筹集粮草，调集延绥、庄浪、兰州、靖州、榆林的军队。可是回程路远，自己的船只还没准备好，就先在花马池驻扎下来，等着军队集结完毕再转移到灵州。过了一阵子，延绥游击姜显谟、都司萧如蕙，甘州前任总兵张杰和麻贵率领的军队都到了，大家一起再次进攻镇城。
那些贼人想了个坏主意，他们觉得延绥和榆林的军队出兵后，后方会空虚，于是就勾结了黄台吉的妻子，让她儿子舍达大、侄子火落赤、还有个叫土昧铁雷的，去袭击旧安边、砖井堡，以此来牵制我们的军队。承恩又用计策配合敌军，埋伏在延汉渠附近，抢走了两百辆粮车。老学曾从花马池回到灵州，结果被围困了，幸好及时得到救援才解围。那些贼人几次攻城都没攻下来，恼羞成怒之下，竟然杀了庆王妃，还抢走了宫里所有的金银财宝。牛秉忠在战斗中右腿受伤，最后军队不得不撤退。皇上听信了尚书星的奏报，赐给学曾尚方宝剑，让他督促作战。
这时候，宁夏巡抚朱正色、甘肃巡抚叶梦熊、监军御史梅国桢，还有几位大将刘承嗣、董一奎、李如松陆续赶到军中。六月，大家再次攻城，可是连续作战却还是没能拿下。叶梦熊，字男兆，是广东归善人，嘉靖四十年考中进士。他先是在福清当县令，后来到户部当主事，负责给宁夏运送军饷。之后升任御史，因为进谏受了把汉那吉降罪的处罚，被贬到郧阳当丞。后来又升迁，做了赣州知府，平定了黄乡的贼乱。之后又升任浙江副使，后来又调到永平。万历十七年冬天，他从山东布政使升任右佥都御史，巡抚贵州。不久又调任陕西，升任右副都御史。因为请求讨伐撦力克的建议与经略洛议相左，朝廷当时支持洛议，所以没采纳他的意见。
后来撦力克东归，洛也回到了宣府、大同，朝廷就调叶梦熊去甘肃，让他和学曾一起办事。叶梦熊为人胆识过人，敢于承担责任。叛乱发生后，他上书请求亲自讨伐贼寇，皇上也同意了。六月，他到达灵州，与学曾会合。
国桢，字克生，是麻城人。从小就觉得自己很厉害，很擅长骑马射箭。万历十一年考中了进士。 然后被任命为固安县的知县。
有个太监跑到国桢那儿，想让他向老百姓多收点税。国桢就假装答应了，还故意让老百姓卖老婆来交税。那对可怜的夫妻哭得死去活来，太监一看这情况，赶紧把收税的文书给撕了。
后来国桢升职当了御史。 正好赶上朝廷要重新启用学曾师，但一直没什么进展。那时候，宁远伯李成梁正被很多人批评，朝廷正讨论要不要派他当大将，大家都不敢轻易做决定。 只有国桢一个人上书力保李成梁。
最后朝廷决定派李成梁的儿子李如松当提督，率领辽东、宣府、大同、山西几个地方的军队出征。而国桢则负责监军，所以他和李如松一起去了宁夏。
一开始，学曾想招降东旸、朝，想让他们父子自首赎罪，就派叶得新去。这四个人当时正商量着一起死呢，结果叶得新腿被打断了，被关进了监狱。巡抚朱正色觉得这帮贼人诡计多端，想投降，而张杰曾经是宁夏的总兵，和朝关系不错，于是就派张杰进城招降。朝就让人抬着叶得新去见张杰，叶得新对着贼人一顿痛骂，结果被杀了，张杰也被扣押起来，没放他走。学曾因为替贼人求抚慰而被皇帝狠狠地批评了一顿。
这时候，城里的百户姚钦和武生张遐龄偷偷把信射到城外，约好里应外合，半夜里点火为号。可是外边的军队没来，贼人就杀了他们自己的五十个同伙，姚钦偷偷从城里逃出来投降了。当时，贼人对外假装求抚以拖延时间，暗地里却勾结其他寇匪来帮忙，但他们的粮食已经快吃光了，形势十分危急。
七月，学曾和梦熊、国桢商量好计策，决定决开黄河大坝，用水淹他们。水一直冲到城下。这时候，套寇卜失兔、庄秃赖带着三万骑兵进攻定边、小盐池，用土昧铁雷做先锋，还另外派宰僧带着一万骑兵从花马池西沙湃口进军，来支援朝。麻贵在右沟打了他们，寇匪稍微受挫，就分兵去了下马关和鸣沙洲。学曾命令游击龚子敬堵住沙湃口，同时下令延绥总兵官董一元去剿灭土昧铁雷的巢穴，斩杀了130多个人头，寇匪大吃一惊，就撤兵了。他们碰上了龚子敬，把他围了个水泄不通，龚子敬战死了，寇匪也逃走了，贼人的援军就这样断了。学曾又加大了决堤放水的力度。
八月，黄河决堤，又赶紧修补，城外水深八九尺，东西城墙崩塌了一百多丈。卜失兔、宰僧又攻打李刚堡。如松、麻贵等人打败了他们，一直追到贺兰山。贼人更加害怕，又想求和，还没谈拢，学曾就因为犯了错被罢免了。朝廷就命令梦熊接替他，梦熊最后成功平定了叛乱。
一开始，学曾派人去请东旸和朝也来帮忙，结果在固原等了十多天，皇帝就责怪他耽误了战机，让敌人有机可乘。后来李昫过河也慢了一些，松山和河套的敌人先一步攻进来了，官军因此又打了败仗。学曾曾经上奏章建议监军不要干预军事行动，皇帝就下令让国桢按照他的话去做，国桢心里挺不高兴的。等到国桢到了军营，他就弹劾那些将领观望不前，还把战败的责任推到学曾身上，说他耽误了战机。给事中许子伟也弹劾学曾被招抚政策迷惑了，误了国家大事。国桢还说，佥事跟着府兵从城墙上跳下去，敌人只派了四个人下去抓他，咱们的军队就在旁边却不敢上前；还有就是北方的敌人几万人马切断了我们的粮道，杀戮无数，却隐瞒不报。
皇帝听了非常生气，就把学曾抓到京城来了。然而，学曾被抓还不到一个月，宁夏城就被攻破了，大军进城了，敌人最终还是被消灭了。学曾被免职后，梦熊接替了他的位置，也得到了尚方宝剑。当时，梦熊负责调度灵州的军队，只有国桢担任宁夏的监军。敌人被围困很久，粮食吃光了，又得不到支援，而且城墙被水泡坏，更加严重地崩塌了。国桢带着将领们向南关撤退。秉忠第一个冲上去，国桢大声呼喊，其他将领都跟着冲了上去。敌人退守大城，攻打了几天也没攻下来。国桢就派人去离间东旸、朝也和承恩，让他们互相残杀，以此来减轻他们的罪责。这三个人互相猜忌，东旸和朝也先诱杀了承恩的同伙文秀。承恩也和他的同伙周国柱诱杀了东旸和朝也；然后把东旸、朝也和文秀的头都挂在城墙上，打开城门投降了。如松率领军队包围了拜家。拜仓皇自缢，全家自焚而死。梦熊从灵州赶来，下令诛杀拜的党羽和投降的敌人两千人，慰问宗室和百姓。宁夏平定了。梦熊、正色、国桢都上报了捷报，并把俘虏的承恩押解到京城。皇帝在宫门口接受祝贺，下令在闹市里将承恩车裂处死，梦熊、正色、国桢都得到了世袭官职，如松功劳最大，如薰、贵、秉忠等人也分别受到了不同的奖赏。学曾最初被罢官为民，后来根据功劳，恢复了原来的官职，得以致仕。
学曾之前在工作上很卖力。他提出的灌城招降策略，是他自己想出来的。等战事胜利后，皇帝召见大学士赵志皋和张位，他们俩极力为学曾辩解，很多官员也说学曾没罪。国桢还上奏说：“学曾应对稍微慢了点，我建议处罚那些将领来振奋士气，但逮捕学曾的命令是我提出来的，我心里很后悔。如果学曾不能很快洗清冤屈，我将受到后世的指责。”如松也说：“学曾被捕的时候，全军将士都哭了。”梦熊也为学曾说好话。皇帝一开始没同意，后来又恢复了学曾的官职。学曾在家住了几年后去世了。梦熊因为立功被提升为右都御史。
一开始，卜失兔当都督，他的部下切尽台吉最得势。切尽台吉死了以后，卜失兔就控制不住各部族了。郑洛负责经略，主要采取怀柔政策。学曾因为洮河的变乱，认为那些部族要造反，就袭击杀了明安。明安的部下反叛，著力兔、宰僧就公开说跟反叛者是一伙的，卜失兔、庄秃赖也带兵支援他们。等到反叛者被平定后，切尽台吉的亲戚比吉带着著力兔、宰僧、庄秃赖这些人，在花马池塞下磕头认罪求和。梦熊上奏请求皇帝开恩。皇帝因为梦熊一开始支持学曾，后来又改变了说法，责怪他前后矛盾，命令他一定要让那些部族把叛乱的人绑起来赎罪。著力兔他们更坚决地求和，梦熊就和巡抚田乐一起上奏，陈述了四镇的战事和和谈的策略，等待朝廷的决定。朝廷内外意见不一，不敢轻易做决定，卜失兔就率领各部族大举入侵定边。总兵官麻贵等人打退了他们，梦熊因此被加封为太子少保。没过多久，切尽台吉的侄子青把都儿侵犯甘肃，总兵官杨浚、副总兵何崇德抵抗，斩杀了六百多敌人。梦熊再次被加封为太子太保、兵部尚书。后来他调任南京工部尚书，由都御史李汶接替他的职务。自从洮河变乱以后，敌寇对中原的侵扰稍微轻了一些。但是招抚的策略失败了，各部族多次入侵，四镇就年年打仗。梦熊虽然功劳很大，但是名望远不如学曾。最后，他也在任上去世了。
国桢因为招降敌人有功，被皇上嘉奖。但是，因为梦熊贪功，杀了投降的敌人，国桢就上奏弹劾了他。梦熊也上奏为自己辩解，说：“我手下那些家丁都是死士，如果缓上一天两天，东旸、朝党那些人又会聚集起来，肯定还会再次作乱。我宁愿背上杀降的罪名，也要斩断祸乱的根源。”皇上看后，就下诏书调解了这件事。论功行赏的时候，国桢被提升为太仆寺少卿。一年多后，他又升任右佥都御史，巡抚大同。过了一段时间，他又升任兵部右侍郎，总督宣府、大同、山西三地的军务。他在镇守的三年里，节省了军费十五万多两银子。后来父亲去世，国桢回家奔丧，还没来得及重新上任就去世了，死后被追赠为右都御史。
李化龙，字于田，是长垣人。万历二年考中进士，被任命为嵩县知县。他当时才二十岁，县里的胥吏们就看不起他，想方设法刁难他。李化龙暗中调查他们的奸诈行为，然后把他们全部绳之以法，嵩县的政务一下子就清明了。后来他升任南京工部主事，然后一步步升到右通政使。
万历二十二年夏天，李化龙被提升为右佥都御史，巡抚辽东。当时，总兵官李成梁打败并杀死了泰宁首领速把亥，但是速把亥的儿子把兔儿和弟弟炒花占据了辽阳以北的地区，盘踞在两河之间，并且勾结土蛮作乱。那年四月，把兔儿包围了辽阳，朵颜小歹青、福余首领伯言儿分别袭击锦州和义州，抢掠了清细河地区，当时的巡抚韩取善因此被免职。李化龙上任才两个月，把兔儿和伯言儿就率兵攻打镇武，又和土蛮首领卜言台周一起进攻右屯。把兔儿先到了吴家坟。李化龙和总兵官董一元商量好计策，先攻击把兔儿和伯言儿，结果伯言儿被流矢射死，把兔儿也受了伤。卜言台周到达后，攻打右屯却没成功，也撤兵了。于是把兔儿、小歹青、卜言台周又联合起来，想报仇雪恨。李化龙和董一元严加防备。董一元又出塞追击，大获全胜，把兔儿因为伤势过重最终死去，边境地区才安定下来。详细情况可以参考董一元的传记。李化龙后来升任兵部右侍郎。
明年，小歹青这小子后悔了，想赔礼道歉，请求在义州开个木材市场，顺便通报说朵颜长昂要来犯边。结果，长昂果然攻打锦州和义州，副总兵李如梅把他们打退了。小歹青既然表现出了诚意，化龙就答应了他的请求。然后上奏朝廷说：
环辽地区全是敌人啊，北方那些土蛮部落多得数不清。靠近边境的，直宁州前面是长昂，直锦州、义州前面是小歹青，直广宁、辽阳、沈阳前面是把兔、炒花、花大，直开原、铁岭前面是伯言、暖兔，至于东边海西地区，还有猛骨孛罗、那林孛罗、卜寨这些部落，都跟辽地的边境紧紧相连。他们经常在边境附近打猎，彼此的报警声都能听得见，简直就是我们肘腋之患啊！自从那卜部落被剿灭后，好几年东边都没什么战事了。去年把兔、伯言战死，炒花、花大被打得落花流水。现在伯言的儿子宰赛受到了惩罚，到广宁来经商，辽阳、沈阳、开原、铁岭之间的警报也越来越少了。现在还没完全驯服的，就只有小歹青和长昂了。
小歹青这个人向来凶狠狡诈，在各部落里很厉害。他一会儿帮着长昂，一会儿又帮着炒花，大规模行动时能带几万人马，小规模偷袭时就带着骑兵在锦州、义州一带神出鬼没。自从周之望、柏朝翠战死后，就没人敢向他们射一支箭了。凌河上下几百里地，到处都是白骨，老百姓都没个安宁日子过。那些有远见的官员总是担心河西地区守不住。现在他竟然主动来请求开市，我四处询问了将领和当地居民，大家一致认为开设木材市场有五大好处。
河西地区没有树木，树木都在边境以外的地方。自从叛乱以来，河西地区一直依靠河东地区供应木材，而且边境警报又不断传来。所以河西的木材比玉还贵，要是贸易通畅的话，木材就用不完了。这就是第一个好处。
有些人担心那些小股的歹青（指盗贼）会不守信用。其实不用担心，他们把贸易当成谋生的手段，在贸易的时候肯定不会抢劫。就算他们今年贸易，明年抢劫，我们也已经得到了今年他们不抢劫的好处了。这就是第二个好处。
辽东的马市，是成祖皇帝开设的，没有其他的赏赐，只是允许商人百姓进行交易。木材市场和马市一样，对百姓有利，而朝廷不用花费什么。这就是第三个好处。
大规模的入侵危害很大，但是发生的次数少；零星的小偷小摸危害小，但是发生的次数多。那些小股的歹青不会抢劫锦州和义州，所以零星的偷盗就少了。而且，我们不向西边供应昂贵的木材，不向东边供应炒花（一种贵重的商品），敌人的势力就会逐渐瓦解。这样一来，宁远和广宁的危机也会逐渐减轻。况且，大规模的入侵都会提前预报，我们也能提前做好准备。这就是第四个好处。
因为零星的偷盗很少，边境百姓就能更好地修筑防御工事。这就是第五个好处。
奏章递交上去了，皇帝批准了。后来，化龙因为生病离开了，木材市场也停止了。之后，总兵官马林又建议开放木材市场，但是和巡抚李植意见相左，争论了很久，也没能解决，那些小股的歹青又开始作乱了。
三月，我（化龙）升官了，被任命为总督湖广、川、贵军务，同时兼任四川巡抚，去讨伐播州叛臣杨应龙。这杨应龙的祖上叫杨铿，明朝初期归顺朝廷，被封为宣慰使。杨应龙这个人，心狠手辣，嗜杀成性。他多次被朝廷征调出兵，仗着自己立过功，就变得骄傲自满，目中无人。他知道四川的兵力薄弱，心里一直想着要占据四川，经常偷偷地去抢掠州县。他宠爱一个叫田雌凤的小妾，竟然听信田雌凤的谗言，杀死了自己的妻子张氏，还灭了张氏的家。他用这种残酷的手段来立威，结果他手下的五司七姓都受不了他的压迫，跑到贵州告发了他。当时的四川巡抚叶梦熊上书朝廷，请求出兵讨伐，但朝廷没同意，只是把杨应龙抓到重庆关了起来。
杨应龙耍了个心眼，假装要带兵去打倭寇，以此来邀功请赏，结果逃跑了。朝廷又把他抓了起来，但他就是不肯出来。四川巡抚王继光带兵去讨伐他，结果在白石被杨应龙打败了，杨应龙还把责任推到苗族身上。朝廷就派邢玠来总督军务。当时朝廷正忙着东征西讨，没时间彻底解决杨应龙的问题，于是就采取了招抚的策略。杨应龙更加肆无忌惮地拉拢苗族，抢夺五司七姓的地盘，还把湖广的四十八个屯田都占为己有，每年都出来抢掠。今年二月，他在飞练堡打败了官军，都司杨国柱、指挥李廷栋等人都战死了。之后，他又杀死了綦江参将房嘉宠和游击张良贤，把他们的尸体扔进江里。杨应龙手下的伪军师孙时泰建议他直接攻打重庆，然后攻打成都，绑架蜀王当人质，但是杨应龙却犹豫不决，一直声称只是为了争夺地界，希望能像以前那样得到朝廷的赦免。我到达成都后，援兵还没到，我也错误地对他说了些好话，想拖延时间。
皇帝听说綦江失守了，气得不得了，立刻把前任四川、贵州巡抚谭希思撤职查办，并且赐给他一把“化龙剑”，让他全权负责去剿灭叛军。叛军烧了东坡、烂桥，堵塞了湖广和贵州的道路，又烧了龙泉，都司杨惟忠也被他们打跑了。化龙弹劾那些不听命令的大帅，沈尚文被抓起来审问，童元镇、刘廷都被革职降级，去做些杂役。各路军队集结完毕，化龙先派了三万水西兵去贵州守卫，切断叛军招募苗人的道路，然后自己移师重庆，在那里举行盛大的誓师大会。
第二年二月，大军分八路进攻。四川方面四路大军：总兵官刘綎从綦江出发；总兵官马孔英从南川出发；总兵官吴广从合江出发；副将曹希彬受吴广节制，从永宁出发。贵州方面三路大军：总兵官童元镇从乌江出发；参将朱鹤龄受童元镇节制，和宣慰使安疆臣一起从沙溪出发；总兵官李应祥从兴隆出发。 湖广方面一路大军分成两翼：总兵官陈璘从偏桥出发；副总兵陈良玭受陈璘节制，从龙泉出发。每路军队有三万人，其中官兵占三分之一，土司兵占七分之三。贵州巡抚郭子章驻守贵阳，湖广巡抚支可大移驻沅州，化龙自己率领中军进行策应。因为楚地（湖南）地广人稀，皇帝又提拔江铎为佥都御史，巡抚偏沅地区。从江铎开始，才正式设置了偏沅巡抚这个职位。
推官高杰先是用南川的军队进攻，占领了桑木镇，然后又从綦江方向进军。应龙把两万精兵交给儿子朝栋，说：“你攻破綦江，直奔南川，把他们的所有物资都烧光，他们就没办法了。”结果跟各路军队交战，都惨败了，应龙跺着脚叹气说：“我不该不用平时制定的策略，这下要死了！” 有人说水西的土匪勾结了化龙，化龙就问责了疆臣，杀了那个土匪的使者，两家彻底断绝了关系。乌江的军队战败的消息传到下元镇，众将士更加奋勇。高杰先进入娄山关，直逼海龙囤，沐璘和疆臣的军队也到了。贼军形势危急，在囤内死守，派人诈降。化龙下令诸将斩杀使者，烧掉降书。因为高杰和应龙以前有交情，就劝告高杰不要跟叛军勾结，高杰捆绑了那个诈降的人来表明自己的清白。八路大军都聚集在囤下，筑起长长的包围圈困住他们，轮番进攻。
六月，高杰攻破了土城和月城，应龙走投无路，和他的两个妾一起上吊自杀了。第二天早上，官军进入城内，七个儿子都被抓住了。朝廷下令把应龙的尸体和儿子朝栋在集市上枭首示众。从出兵到消灭叛军，一共一百十四天。播州杨氏家族从唐朝乾符年间开始，传到应龙这一代，已经二十九世，八百多年了，到应龙这里就断绝了。朝廷把他们的地盘设立为遵义府和平越府，分别隶属于四川和贵州。
化龙刚开始听说父亲去世的消息，正值金戈铁马的战事，等到平叛后才请求回家奔丧料理后事。三十一年四月，他被任命为工部右侍郎，负责治理河道，和淮扬巡抚李三才一起上奏疏，建议开挖淤塞的河道，从直河进入泇口，到达夏镇，一共二百六十里，这样就能避开黄河吕梁的险要地段。后来他又因为丁忧离职，没有继任。朝廷表彰他平定播州的功劳，晋升他为兵部尚书，加封少保，还荫封一个儿子世袭锦衣指挥使的职位。
三十五岁那年夏天，他升任兵部尚书。他觉得京营是国家的根本，就上奏朝廷，提出了“十一滥”、“十二苦”、“十九宜”，又提出了关于屯田的十二条建议，但这些建议都没被采纳。从二十七岁以后，兵部的左侍郎和右侍郎的职位都空缺着。没过多久，尚书萧大亨也退休了，他就代理兵部尚书的职务。
三十七年正月，京城里谣言四起，说敌寇要打来了，老百姓争先恐后地躲藏起来，从边境逃进京城的人也有好几万，九个城门白天都关闭着。大臣们说兵部就只有一个尚书，怎么应付突发事件呢？皇帝也没理会。辽东的士兵有两万多人，都是些老弱病残，而税监高淮又横征暴敛，辽东百姓对高淮恨得牙痒痒。他请求朝廷停止税收，并且增加一万兵力，还详细地提出了关于军粮、军饷和作战策略的建议，但皇帝还是没有采纳。他做到一品大员的最高级别，被加封为柱国、少傅兼太子太保。最后他去世了，享年七十岁。死后被追赠少师，又加赠太师，谥号襄毅。
他文武双全。播州之战时，因为刘綎骄傲自负，他先挫了他的锐气，然后再推荐他的才能，所以刘綎最后尽心尽力地作战。开河的功劳，使得漕运从此畅通无阻，详情可以参考《河渠志》。
江铎，字士振，是杭州人。他的高祖父江玭，景泰年间做过礼科给事中，弹劾石亨专权，蒙蔽皇上，为人正直敢言。官做到山东参政。他的曾祖父江澜，正德年间做过南京礼部尚书，死后谥号文昭。他的祖父江晓，嘉靖年间做过工部侍郎。他的父亲江圻，万历初年做过广西提学佥事。父母生病的时候，他亲自煎药，甚至尝粪便。父母去世后，他守孝三年，住草屋，穿粗衣，经过父母的房间都要低头，他的妻子经过丈夫的房间也是如此。他去世后，学生们私下给他谥号“孝端先生”。从江玭到江铎，他们家五代都是进士。而江晓的弟弟江晖，正德年间做过庶吉士，和舒芬等人一起上书劝谏皇帝不要南巡，结果被打板子。世宗年间，他从编修官外放做河南佥事。江铎在万历二年考中进士。
他先在刑部做主事，后来官做到山西按察使，又升任抚治偏沅地区。在夹击杨应龙的战役中立下战功，他和郭子章都因此被允许让一个儿子世袭锦衣卫指挥使的职位。母亲去世后，他请求朝廷允许他回家奔丧，但朝廷命令他继续讨伐皮林等地的蛮族，他平定了这些蛮族。详情可以参考《陈璘传》。因为劳累和疾病，他退休回家。去世后，被追赠兵部右侍郎。
话说啊，大家伙儿都夸李化龙厉害！说他平定了哱拜的叛乱，真是不容易。哱拜这人啊，虽然当了官，可根基不稳，底子薄。他突然造反，占领了镇城，还勾结外敌，边疆地区一下就乱套了，军队防备松懈，也不是一天两天的事了。杨应龙那家伙更是坏事做绝，罪孽深重，最终自取灭亡。可他盘踞那么久，地势又险要，要不是李化龙带兵打仗厉害，这仗还真不好打！李化龙的功劳，可以和韩雍、项忠相比，比起宁夏那场战役，难度可差远了！
唉，这哱拜啊，就是个小人，虽然朝廷给了他官职，但他势力不强，底子薄。他突然造反，占领了城池，还和外面的敌人勾结，边境地区顿时乱成一锅粥，军队防备力量也早就松懈了。杨应龙更是个十恶不赦的家伙，坏事做绝，最终自食恶果，咎由自取。但是，他占据那地方时间长，地势又险峻，如果不是李化龙带兵打仗厉害，想要取得胜利，可不容易啊！李化龙的功劳，跟韩雍、项忠不相上下，比起宁夏那场战役，难度简直天壤之别！
