古代皇帝的陵墓和庙宇可多了，比如三皇、圣师（孔子）、五祀、国马神、南京神庙、功臣庙、京师九庙，还有各种各样的神祠和厉坛。
洪武三年，朱元璋派人去调查历代帝王的陵寝，还命令各省都画图送来，一共收集了七十九份图纸。礼部官员们仔细研究，选出了功德显著的三十六位帝王，分别是伏羲、神农、黄帝、少昊、颛顼、唐尧、虞舜、夏禹、商汤、中宗、高宗、周文王、武王、成王、康王、汉高祖、文帝、景帝、武帝、宣帝、光武帝、明帝、章帝、魏文帝、隋高祖、唐高祖、太宗、宪宗、宣宗、周世宗、宋太祖、太宗、真宗、仁宗、孝宗、理宗。 然后，朝廷为他们制作了衮冕（古代帝王的礼服），准备了香和祭品，还派秘书监丞陶谊等人去祭祀，朱元璋亲自写了祭文给他们带去。每个陵墓都用二十五两白金作为祭祀的物品。那些被破坏的陵墓，就让人修缮；那些破旧的庙宇，就让人修补；没庙的，就设坛祭祀；还命令有关部门禁止在陵墓附近砍柴采草。每年按时祭祀，祭祀用的牲畜都是最好的太牢（牛羊猪）。
四年过去了，礼部商量决定，把全国各地要祭祀的帝王总数定为三十五位。在河南省的有十位：陈州祭祀伏羲和商高宗，孟津祭祀汉光武帝，洛阳祭祀汉明帝和章帝，郑州祭祀周世宗，巩县祭祀宋太祖、太宗、真宗和仁宗。在山西省有一位：荥河祭祀商汤。在山东省有两：东平祭祀唐尧，曲阜祭祀少昊。在北京（北平）有三：内黄祭祀商中宗，滑县祭祀颛顼和高辛氏。在湖北省（湖广）有两：酃县祭祀神农氏，宁远（今湖南宁远）祭祀虞舜。在浙江省有两：会稽祭祀夏禹和宋孝宗。在陕西省有十五位：中部祭祀黄帝，咸阳祭祀周文王、武王、成王、康王、宣王，汉高祖、景帝，咸宁祭祀汉文帝，兴平祭祀汉武帝，长安祭祀汉宣帝，三原祭祀唐高祖，醴泉祭祀唐太宗，蒲城祭祀唐宪宗，泾阳祭祀唐宣宗。每年祭祀的时间，定在春季和秋季的第一个朔日（农历初一）。然后就派使者到各个陵墓去祭祀。每个陵墓都立一块碑，刻上祭祀日期和祭品的数量，让当地官府负责看守。
后来又下令，让当地官府每年按时修缮陵墓，并安排两个人看守。每三年，还要送去祭文、香帛，以及太常寺的乐舞人员，到各地去举行隆重的祭祀仪式。最初祭祀的帝王，时间上最远到周宣王，汉朝则到汉明帝、章帝。后来又增加了在赵城祭祀女娲，在富平祭祀后魏文帝，在顺天（今北京）祭祀元世祖，在会稽祭祀宋理宗，这样一共祭祀了三十六位帝王。之后又增加了在扶风祭祀隋高祖，但是宋理宗的祭祀又取消了。最后又规定，各地官府要在春秋两季的仲月（农历二月或八月）上旬选择吉日进行祭祀。
六年的时候，皇帝觉得应该在京城建庙祭祀五帝、三王以及汉、唐、宋朝开国皇帝这些牛人，于是就在钦天山的北边修建了历代帝王庙。庙的结构模仿太庙，一个大殿里分好几个房间，一共五个房间：中间一个房间供奉三皇，东边一个房间供奉五帝，西边一个房间供奉夏禹、商汤、周文王；再往东一个房间供奉周武王、汉光武帝、唐太宗；再往西一个房间供奉汉高祖、唐高祖、宋太祖、元世祖。每年春秋两季的二月上旬，逢甲日就要举行祭祀活动。
后来，皇帝觉得周文王始终是臣子的身份，唐高祖是靠唐太宗打下的天下才当上皇帝的，所以就取消了他们的祭祀，改成祭祀隋高祖。到了第七年，皇帝下令在帝王庙里给每位皇帝都塑金光闪闪的坐像，只有伏羲和神农因为传说中没穿衣服，所以不用给他们塑像加冕服。八月，皇帝亲自到新庙里祭祀。结果没多久，又把隋高祖的祭祀给取消了。
公元1242年，皇帝下令每年祭祀天地的时候，都要在太庙的大祀殿里，一起祭祀历代帝王。 同时，规定每年农历八月十五左右选个好日子，派官员去各帝王的陵墓祭祀，春天祭祀太庙的活动就取消了。 另外，还规定每三年去各个陵墓祭祀一次，那一年太庙的祭祀活动就停掉。
同年，皇帝下令让历代名臣也一起祭祀。主管礼仪的官员李原上报了一份名单，推荐了36个人。 皇帝觉得宋朝的赵普对太祖赵匡胤不够忠诚，不能列入祭祀名单。 元朝的“四杰”，以木华黎为首，不能只祭祀孙子而不祭祀祖先，所以可以祭祀木华黎，但不能祭祀安童。既然要祭祀伯颜，那阿术就不用祭祀了。汉朝的陈平、冯异，宋朝的潘美，他们都始终对国家忠诚，可以列入祭祀名单。
最后，确定了以下37位名臣，一起在太庙东西厢房祭祀，一共建了四个祭坛：风后、力牧、皋陶、夔、龙、伯夷、伯益、伊尹、傅说、周公旦、召公奭、太公望、召虎、方叔、张良、萧何、曹参、陈平、周勃、邓禹、冯异、诸葛亮、房玄龄、杜如晦、李靖、郭子仪、李晟、曹彬、潘美、韩世忠、岳飞、张浚、木华黎、博尔忽、博尔术、赤老温、伯颜。 之前，太公望在武成王庙里也设有祭祀，每年都派官员去祭祀，仪式和释奠一样隆重。 到了现在，就把武成王庙的祭祀活动取消了，也把“王”的称号去掉了。
永乐皇帝迁都北京后，祭祀历代帝王的仪式是由南京太常寺的官员前往南京执行的。到了嘉靖九年，朝廷决定取消历代帝王在南郊的从祀仪式，下令在北京城西建造一座历代帝王庙，每年春秋两季都要举行祭祀。后来，南京的帝王庙祭祀也取消了。嘉靖十年二月，帝王庙还没建好，皇帝就亲自在文华殿祭祀历代帝王，一共设了五个祭坛，东西两侧的丹陛上还分别设了四个祭祀名臣的祭坛。礼部尚书李时言提议说：“以前的祭祀仪式上有赐福胙的环节，赐福是自上而下的意思，只有祭祀郊庙社稷才应该用。祭祀历代帝王，只应该说‘答谢’就好。”皇帝批准了他的建议。
嘉靖十一年夏天，帝王庙终于建成了，取名为“景德崇圣之殿”。大殿有五个房间，东西两侧还有厢房，殿后是祭器库房，殿前是景德门。景德门外还有神库、神厨、宰牲亭和钟楼。庙宇东西两侧各有一条街，叫做景德街。嘉靖十一年八月壬辰日，皇帝亲自举行祭祀仪式。皇帝从中门进入，迎神、接受赐福胙、送神，每个环节都行两次礼。此后，每年都派一位大臣去主持祭祀，另外四位大臣分担献祭的职责。如果遇到子、午、卯、酉年要祭祀陵寝的情况，那就停止秋季的祭祀。嘉靖二十四年，礼科给事中陈棐建议取消元世祖陵庙的祭祀，以及对木华黎等人的从祀，并将唐太宗和宋太祖迁回同一个祭祀场所。最终，祭祀的帝王共有十五位，从祀的名臣有三十二人。
明朝初期沿袭元朝的制度，在三月三日和九月九日祭祀三皇。洪武元年，规定用太牢来祭祀三皇。洪武二年，又规定以句芒、祝融、风后、力牧作为三皇的配祀，并让俞跗、桐君、僦贷季、少师、雷公、鬼臾区、伯高、岐伯、少俞、高阳这十位名医也一同从祀，祭祀仪式与释奠相同。洪武四年，朱元璋认为天下郡县都祭祀三皇的行为有失尊崇，礼部官员们讨论后认为：“唐玄宗曾经在京城设立三皇五帝庙，到了元成宗时期，才在府州县设立三皇庙。春秋两季祭祀三皇，却以医药之神为主祭，这很不合礼制。”朱元璋说：“三皇继承天命，建立了极高的功业，开启了万世教化的先河，怎么能和医药之神混为一谈呢？”于是下令天下郡县不得随意祭祀三皇。
正德十一年，在秦州建起了伏羲庙。秦州，就是以前的成纪，这事儿是巡按御史冯时雄提出来的。
嘉靖年间，在太医院北边建了个三皇庙，叫景惠殿。里面供奉着三皇和他们的四个配偶。东边厢房里供奉着僦贷季、岐伯、伯高、鬼臾区、俞跗、少俞、少师、桐君、雷公、马师皇、伊尹、扁鹊、淳于意、张机这十四位医圣；西边厢房里供奉着华陀、王叔和、皇甫谧、葛洪、巢元方、孙思邈、韦慈藏、王冰、钱乙、朱肱、李杲、刘完素、张元素、朱彦修这十四位医圣。每年春天和秋天的上甲日，礼部官员去主持祭祀仪式，太医院的两位官员分别献祭，祭品是少牢。还在里面建了个圣济殿，祭祀历代名医，由太医院的官员负责。后来，嘉靖二十一年，皇帝觉得庙太小了，就下令扩建。
世宗皇帝开始祭祀圣师。祭祀的对象是伏羲氏、神农氏、轩辕氏、以及陶唐氏、有虞氏这两位帝师，还有夏禹王、商汤王、周文王、周武王这四位王师，这九位圣师都面向南方。左边是周公，右边是孔子，这两位先师都面向东西。每年春秋两季开讲之前一天，皇帝都要穿戴皮弁，跪拜行释奠礼。祭品是羹、酒、果脯和帛，在文华殿东室举行祭祀。
一开始，文华殿东室里供奉着佛像，皇帝觉得不合适，就把佛像撤了，改成祭祀先圣先师。皇帝自己还写了祭文，亲自主持了安放神位的仪式。其他的大臣和礼官等仪式结束后，再进去行礼。早先，洪武初年，司业宋濂建议，按照建安熊氏的说法，把伏羲尊为道统之祖，然后依次是神农、黄帝、尧、舜、禹、汤、文王、武王，这样在天子学宫里祭祀，就能更好地尊崇道统。但是太祖皇帝没同意。直到世宗皇帝才采纳了这个建议。嘉靖十六年，祭祀地点移到了永明殿后面，祭祀仪式和以前一样。后来，就派官员代替皇帝祭祀了。到了隆庆初年，祭祀又回到了文华殿东室。
话说啊，从汉朝、晋朝一直到隋朝，人们都管孔子叫“先师”或者“先圣”、“宣尼”、“宣父”，到了唐朝，追封他为“文宣王”，宋朝又加封为“至圣”，元朝还给他加了称号，叫“大成”。朱元璋打下江山后，第一个去拜访的就是孔子的庙。洪武元年二月，他下令用最隆重的祭祀仪式在国子监祭祀孔子，还派人去曲阜祭祀。临行前，他还特意交代使者说：“孔子的学说博大精深，跟天地一样长久，历代统治者都非常重视对他的祭祀。我作为天下之主，希望大力推行儒家教化，实行先圣的教诲。现在国子监的祭祀已经完成了，你们再去曲阜祭祀，一定要恭敬谨慎啊！”他还规定，每年春天和秋天的上丁日，皇帝都要亲自去国子监上香祭祀，由丞相行初献礼，翰林学士行亚献礼，国子祭酒行终献礼。祭祀之前，皇帝要斋戒，参与祭祀的官员也要提前斋戒。祭祀前一天，皇帝要穿着正式的祭祀服装，在奉天殿上香。到了祭祀当天，献官们再行祭祀礼仪。
过了三年，朱元璋下令取消其他神祇的封号，只有孔子的爵位保持不变。他还命令每年都给曲阜孔庙拨款，供奉祭祀用品，让衍圣公负责祭祀事务。四年后，礼部制定了祭祀的具体礼仪和器物，把原来八样祭器改成了十样，还把原来用木头做的祭器都换成了瓷器，祭祀用的牲畜也改成了熟肉。乐舞人员也增加了，一共有一百一十人。礼部想从老百姓里挑选一些优秀的人来担任乐舞人员，朱元璋说：“乐舞是学问人的事，更何况祭祀是为了崇敬老师，应该从国子监的学生和大臣的子弟中挑选，好好培训他们。”五年后，朱元璋下令取消孟子的配享，过了一年，他又说：“孟子辨别异端邪说，阐明了孔子的学说，还是应该让他继续配享。”七年二月，因为上丁日那天日食，就把祭祀日期改成了仲丁日。
十五年，新建的太学终于完工了。庙就在学堂的东边，中间是宏伟的大成殿，两边是厢房，前面是大成门，门两边各摆着二十四根戟。大门的东边是祭祀用的厨房，西边是存放祭品的仓库，前面还有一座灵星门。从动工开始，皇帝就多次来视察。等到建成后，皇帝就派官员去祭祀。皇帝不仅亲自参加了祭祀典礼，还下令全国各地都要祭祀孔子，并且颁布了祭祀的仪式规范。所有府、州、县的学堂，祭祀用的笾豆都要用八套，祭祀用的器物、牲畜，都要从国子监（国学）这边统一准备。三献礼的仪式都一样，十哲（指十位古代贤人）在两边的厢房各进行一次祭祀。进行祭祀的人，都要由相应的官员来担任，比如有布政司的，就由布政司的官员来主持；分献的仪式，则由本学堂的儒学教职人员和德高望重的儒士来负责。每年春秋两季的仲月上丁日举行祭祀活动。一开始，国子监祭祀由祭酒主持，后来改由翰林院的官员主持，不过祭酒初到任时，还是要亲自主持一次祭祀。
十七年，皇帝下令每月初一和十五，祭酒以下的官员都要举行释菜礼，郡县长官以下的官员都要到学堂来行香。二十六年，皇帝把大成乐颁布到全国各地。二十八年，因为行人司副杨砥的建议，取消了汉代扬雄的从祀，增加了董仲舒。三十年，因为国子监的孔子庙太小了，皇帝下令工部重新修建，设计图纸都是皇帝亲自规划的。大成殿的每个门都有六根柱子，灵星门有三根，东西厢房共有七十六根柱子，神厨和仓库各八根柱子，宰杀牲畜的地方有六根柱子。永乐初年，在太学的东边修建了孔庙。
宣德三年，皇上让万县的训导李译言负责检查一下全国各地祭祀先贤的名单，然后把最终结果公布全国。十年后，慈利的教谕蒋明建议把元朝的学者吴澄也列入祭祀名单。大学士杨士奇等人觉得这个建议可以，就同意了。
正统二年，皇上又把宋朝的学者胡安国、蔡沈、真德秀列入祭祀名单。三年，皇上禁止全国在道教和佛教的庙宇里祭祀孔子。孔子的后代、颜回的后代、孟子的后代，他们的老师裴侃上奏说：“全国的孔庙，只讲究按照传道授业的顺序来排列祭祀者的位置。但是孔子的家庙，应该按照父子关系来排序，这样才符合伦理。颜回、曾子、子思都是孔子的学生，应该在正殿里陪祀；而颜回的父亲颜无繇、曾子的父亲曾子昽、孔子的儿子孔鲤（伯鱼）都是孔子的长辈，应该在廊庑里从祀。现在这样安排，不仅名分不对，恐怕连神灵自己也觉得不安。更何况孔子的父亲叔梁纥已经追封为‘启圣王’，在孔庙大成殿西边专门建了殿宇来祭祀他，而颜回和孟子的父亲都封了公爵，唯独伯鱼和曾子昽还是侯爵，所以请求追封他们为公爵，和颜回、孟子的父亲一起在启圣王殿陪祀。”皇上听了之后，就让礼部去办理这件事，并且还讨论要给伯鱼和曾子昽加封更高的爵位。
成化二年，皇上追封董仲舒为广川伯，胡安国为建宁伯，蔡沈为崇安伯，真德秀为浦城伯。十二年，皇上采纳了祭酒周洪谟的建议，把祭祀孔子的乐舞表演人员增加到八佾，祭祀用的笾和豆也各增加到十二个。
弘治八年，皇上追封杨时为将乐伯，他的祭祀位置在司马光之后。九年，皇上又把祭祀孔子的乐舞表演人员增加到七十二人，跟天子祭祀的规格一样。十二年，孔子的家庙——阙里孔庙毁坏了，皇上命令有关部门重建。十七年，庙宇建好了，皇上派大学士李东阳去祭祀，并且立了一块御制的碑文。正德十六年，皇上命令有关部门重建位于衢州的孔氏家庙，并且拨款给钱，负责重建工程，还派博士孔承义负责祭祀。
嘉靖九年，大学士张璁跟皇帝说：“咱们祖宗的祭祀典礼，有些地方该改改了。叔梁纥是孔子的爸爸，颜路、曾昽、孔鲤分别是颜子、曾子、子思的爸爸，这三位都陪着孔子一起在庙里祭祀，而他们的爸爸们却只能在两边厢房里陪着，想想看，圣人们心里能舒服吗？我觉得啊，应该在大成殿后面另建一间屋子，专门祭祀叔梁纥，让颜路、曾昽、孔鲤陪着一起祭祀。” 皇帝觉得张璁说得有道理。
张璁接着又说：“圣人尊敬天和尊敬父母是一样的重要。现在祭祀用的东西，笾豆有十二样，祭祀用的牲畜是牛犊，这些都跟祭天用的东西一模一样，这也不符合礼制啊。孔子的谥号、穿的衣服，都应该改改。” 张璁顺着皇帝的意思继续说：“孔子应该尊称为‘先圣先师’，不能称‘王’；祭祀的场所应该叫‘庙’，不能叫‘殿’；祭祀应该用木头做的牌位，那些泥塑像应该销毁；笾豆应该用十样，祭祀用的乐舞应该用六佾舞；那些陪祭的公侯伯的爵位称号应该去掉，只称‘先贤先儒’；还有那些陪祭的申党、公伯寮、秦冉等十二个人，应该取消陪祭；林放、蘧瑗等六个人，应该分别在他们家乡祭祀；至于后苍、王通、欧阳修、胡瑗、蔡元定，就让他们继续陪祭吧。”
皇上让礼部和翰林院的官员们一起讨论这件事。编修徐阶上书说，改动孔子的称号和毁掉他的塑像是不合适的。皇上很生气，把徐阶贬官了，然后自己写了篇《正孔子祀典说》，大意是说孔子认为鲁国僭越称王是不对的，那他凭什么自己僭越享受天子的礼仪呢？ 皇上还又写了篇《正孔子祀典申记》，这两篇文章都交给了史馆保存。
接着，杨慎就写了篇《正孔子庙祀典或问》呈给皇上。皇上觉得杨慎的论述详尽而正确，就让礼部也一起讨论。这时候，御史黎贯等人就说了：“咱们圣祖皇帝当初整理祭祀典礼的时候，天下山川河流等各种神祇都取消了他们的称号，唯独先师孔子还是原来的称号，这其中肯定有很深的意思。陛下您怀疑孔子祭祀的礼仪规格接近于祭天，其实孔子是无法企及的，就像天是无法攀登的一样，即使比作天，也不算过分。从唐朝开始就尊孔子为文宣王，已经用了天子的礼乐。宋朝真宗皇帝曾经想封孔子为帝，有人说周朝只称王，不应该加帝号。但是罗从彦的观点是，加帝号也可以。到了周敦颐，认为孔子将永远享受王祭，邵雍也认为仲尼将永远为王。说孔子不应该称王的人，只有吴澄一个人而已。希望陛下您广泛参考大家的意见，务必找到最合适的方案。”黎贯在奏疏里还说：“天地是最尊贵的，父母和老师也是最尊贵的。陛下您敬天尊亲，不应该单单怀疑孔子的王号是僭越的。”皇上因此非常生气，怀疑黎贯借此来指责他追尊皇考的做法不对，认为黎贯是奸邪小人，把他交给法司审问，撤了他的职务。给事中王汝梅等人也极力劝谏说不应该去掉王号，皇上都斥责他们的说法是谬论。
好家伙，这可是个大工程啊！礼部把大臣们都叫来开会，讨论怎么祭祀孔子。他们说，大家都觉得孔子最牛，宋真宗都叫他“至圣”了，意思已经很明白了。所以，孔子的神位就应该写“至圣先师孔子”，那些“王”啊、“大成”啊、“文宣”之类的称呼就都去掉吧。 “大成殿”改名叫“先师庙”，“大成门”改名叫“庙门”。 然后，颜回、曾参、子思、孟子这四个配享的，就分别叫“复圣颜子”、“宗圣曾参”、“述圣子思子”、“亚圣孟子”。 其他的那些学生，就都叫“先贤某子”；左丘明那些人，就都叫“先儒某子”，别再用什么公侯伯的称呼了。 祭祀的规矩，就按照朱元璋当初在南京国子监的规定来办，用木头做神主，尺寸大小都得按规定来。那些塑像，都撤了吧！春秋祭祀，按照建国初期的规矩来，朝廷祭祀用十笾十豆，全国各地的学校就用八笾八豆，乐舞就用六佾舞。每个学校都得单独建个祠堂，祭祀孔子的父亲叔梁纥，神位上写“启圣化孔氏”，再配上颜无繇、曾点、孔鲤、孟孙氏，都叫“先贤某氏”。 至于其他的那些配享的人，是不是该祭祀，还得好好考量考量。 “申党”那个名字，去掉一个“党”字。公伯寮、秦冉、颜何、荀况、戴圣、刘向、贾逵、马融、何休、王肃、王弼、杜预、吴澄这几个，都别再祭祀了。林放、蘧瑗、卢植、郑众、郑玄、服虔、范宁这几个，就让他们各自家乡祭祀吧。 后苍、王通、欧阳修、胡瑗这几位，应该加进去。 最后，就按照这个方案执行了。
后来，又有人提议，把陆九渊也加进去一起祭祀。 这事儿啊，说来话长。 早先朱元璋当皇帝的时候，有个叫宋濂的官员建议把孔子的塑像撤了，改用神主，还建议修改祭祀的礼仪和乐章，结果朱元璋没同意。 到了成祖、宣宗的时候，有个叫程敏政的官员说，马融他们那八个人，应该取消祭祀。 有个叫张九功的官员也跟着提议，说荀况、公伯寮、蘧瑗这些人也应该取消祭祀，并且建议加上后苍、王通、胡瑗。 结果礼部官员周洪谟给否决了。 这次，因为有个叫璁的人大力支持，大家都不敢反对了。 取消塑像，是采纳了宋濂的建议；至于哪些人该祭祀，哪些人不该祭祀，大体上和张九功说的差不多。 至于加上欧阳修，是因为之前关于濮议的事情。
明年，国子监要建启圣公祠了，完工之后，从尚书李时言开始，每年春秋两季都要祭祀，和文庙在同一天。祭祀用的器皿、牲畜、祭品，四配的规格一样；东西两侧配祀的十哲，规格和四配一样；程晌、朱松、蔡元定三位先儒，则在两庑从祀。如果辅臣代替祭祀文庙，那么祭酒就祭祀启圣祠；南京的祭酒祭祀文庙，司业就祭祀启圣祠。就这样定下来了，殿里先师的牌位朝南，四配的牌位东西朝向。稍后，十哲：闵子损、冉子雍、端木子赐、仲子由、卜子商、冉子耕、宰子予、冉子求、言子偃、颛孙子师，他们的牌位也东西朝向。两庑从祀的先贤和先儒有：澹台灭明、宓不齐、原宪、公冶长、南宫适、高柴、漆雕开、樊须、司马耕、公西赤、有若、琴张、申枨、陈亢、巫马施、梁鳣、公昽哀、商瞿、冉孺、颜辛、伯虔、曹恤、冉季、公孙龙、漆雕哆、秦商、漆雕徒父、颜高、商泽、壤驷赤、任不齐、石作蜀、公良孺、公夏首、公肩定、后处、鄡单、奚容蒧、罕父黑、颜祖、荣旂、秦祖、左人郢、句井疆、郑国、公祖句兹、原亢、县成、廉洁、燕伋、叔仲会、颜之仆、邽巽、乐欬、公西舆如、狄黑、孔忠、公西蒧、步叔乘、施之常、秦非、颜哙，以及左丘明、公羊高、谷梁赤、伏胜、高堂生、孔安国、毛苌、董仲舒、后苍、杜子春、王通、韩愈、胡瑗、周敦颐、程颢、欧阳修、邵雍、张载、司马光、程颐、杨时、胡安国、朱熹、张栻、陆九渊、吕祖谦、蔡沈、真德秀、许衡，一共九十一人。
明年国子监就要建好启圣公祠了，到时候，从尚书李时言开始，每年春秋两季都要祭祀，跟文庙同一天。祭祀规格，四配、十哲、从祀的先儒，都按照规定来。
辅臣要是代替祭祀文庙，那祭酒就负责启圣祠的祭祀；南京的祭酒祭文庙，司业就祭启圣祠。 就这样决定了，殿里先师的牌位朝南，四配的牌位在东西两边，十哲和两庑从祀的那些先贤先儒，也都按规矩摆放。 具体都有谁呢？ 太多了，我一口气念完，你记好了啊： (此处略去名单，原文已列出) 一共九十一人。
隆庆五年的时候，朝廷把薛瑄列为陪祀对象，一起祭祀。到了万历年间，又把罗从彦和李侗列为陪祀。万历十二年，朝廷又把陈献章、胡居仁、王守仁列为陪祀对象。万历二十三年，把宋朝周敦颐的父亲周辅成也列入启圣祠陪祀。 还规定每年春分和秋分上丁日，皇帝要在殿上举行祭祀典礼，派大臣祭祀先师及其配祀。这十位哲人，就由翰林院官员和国子监官员各派两人分别进行祭祀。
每个月的初一，以及每次科举考试新科进士放榜后，都要举行释菜礼。府、州、县、卫的学校，各自的提调官都要主持仪式。祭祀用的牲畜是少牢，祭祀的音乐也和太学一样隆重。至于京城各府和各府属县的学校，就只举行释菜礼了。
崇祯十五年，因为左丘明曾经亲自给孔子讲授经书，所以朝廷把左丘明改称为“先贤”。同时，也把宋朝的周敦颐、二程（程颢、程颐）、张载、朱熹、邵雍这六位儒家学者也改称为“先贤”，他们的地位排在七十子（孔子的七十二弟子）之下，汉唐诸儒之上。但是，只有国子监改了祭祀的称呼，孔庙和全国各地的学宫都没来得及实行这个改动。
话说这祭祀军旗和纛旗的事儿，一共分四种情况。第一种，是洪武元年，礼部官员建议说：出兵打仗，该祭祀的旗帜，‘牙旗’是其中一种。《黄帝出军诀》里写着：“牙旗是将军的精气神，也是全军作战的象征。竖起牙旗的时候，一定要选在阳气盛的吉日祭祀。” 至于‘纛’，指的是旗杆上的旗头。《太白阴经》里说：“大将的营帐里要竖起纛旗。天子有六支军队，所以要用六面纛旗，用牦牛尾巴做成，插在左边的战车前面。”唐宋元朝都有祭祀旗纛的习俗，现在咱们也应该在京城建个庙，春天惊蛰那天，秋天霜降那天，派官员去祭祀。
于是皇上就下令在都督府后面建了一座庙，由都督担任祭祀的官员，庙里供奉的是“军牙之神”和“六纛之神”。到了洪武七年二月，皇上还下令让太子和诸位王爷去阅武场祭祀旗纛，搭了七个祭坛，进行了隆重的三献礼。后来，春天祭祀的仪式取消了，只保留了霜降那天在教场祭祀。
第二种情况，是每年年底祭祀太庙的时候，要在承天门外祭祀旗纛。第三种情况，旗纛庙建在山川坛的左边。开始的时候，旗纛和太岁等神一起在城南祭祀。到了洪武九年，才单独给旗纛建了一座庙。每年仲秋，皇上亲自祭祀山川的时候，就派旗手和卫队的官员去祭祀旗纛。正式祭祀的时候，要祭祀旗头大将、六纛大将、五方旗神、掌管战船的神、金鼓角铳炮之神、弓弩飞枪飞石之神、以及阵前阵后神祇五昌等，一共七位神祇，在一个祭坛上，面向南方。皇帝穿着皮弁，从奉天殿出来上香，祭祀的官员则负责具体事务。祭祀的供品和先农坛一样，帛七匹，其中黑二白五。还要埋下牲畜的毛和血，望燎，跟祭祀风云雷雨诸神一样。祭祀完毕，在地上摆上六套酒器，杀六只雄鸡，把鸡血洒在地上祭祀。
第四种情况，永乐年间以后，又多了祭祀神旗的仪式，专门祭祀火雷之神。每个月初一和十五，神机营的提督官要在教场祭祀，用少牢的祭品。所有的旗和纛都放在内府，祭祀的时候再拿出来。
皇帝祭祀军旗的时候，就派武官穿着军装去行礼。全国各地的卫所，都在衙门后面建庙，由指挥使担任主祭官，其他官员依次担任亚献官和终献官。祭祀用的物品，都从京城运送过去。
洪武二年规定，每年年底腊月举行祭祀，在庙门外进行祭祀活动。八年后，礼部上奏说：“五祀的祭祀礼仪，周朝、汉朝、唐朝、宋朝都不一样。现在建议：孟春（正月）祭祀户神，在皇宫大门左边设坛，由司门官主持；孟夏（五月）祭祀灶神，在御膳房设坛，由光禄寺官员主持；季夏（七月）祭祀中霤神，在乾清宫丹墀设坛，由内官主持；孟秋（七月）祭祀门神，在午门左边设坛，由司门官主持；孟冬（十一月）祭祀井神，在宫内大庖的井前设坛，由光禄寺官员主持。四个孟月（正月、五月、七月、十一月）的祭祀，都在太庙祭祀的日子举行；季夏（七月）的祭祀，选择在土旺的日子举行；祭祀用的牲畜，都用少牢（祭祀用的牛羊）。 ”皇帝批准了这个方案。之后把中霤神的祭祀地点改在了奉天殿外文楼前。又规定每年年底，把五祀合起来在太庙西庑下祭祀，由太常寺官员主持仪式。
洪武二年，皇帝下令祭祀马祖、先牧、马社、马步四位神，在后湖筑坛祭祀。礼官说：“《周礼》里记载，春天祭祀马祖，它是天上的天驷星；夏天祭祀先牧，是最初饲养马的人；秋天祭祀马社，是最初骑马的人；冬天祭祀马步，是掌管马匹灾害的神。隋朝沿用周朝的制度，在四季的仲月（每月中间的月份）祭祀。唐朝、宋朝也沿用这个制度。现在规定，在春、秋两季的仲月，选择甲、戊、庚日（天干），派官员去祭祀。建四个祭坛，用当时的乐器演奏，行三献礼。”四年，四川的明升进献了十匹好马，其中一匹白色的马，身长一丈多，无法上马鞍和缰绳。太祖皇帝说：“上天造就的优秀动物，一定有神灵在主管。”于是命令太常寺用少牢祭祀马祖，用四百斤沙子压着它，让人骑着它在御花园里走动，过了一段时间后，它逐渐驯服了。皇帝骑着它在夕阳西下的时候去了清凉山。回来后，皇帝非常高兴，赐名这匹马为“飞越峰”。又命令太常寺祭祀马祖。五年后，把这些神合并在一个祭坛祭祀，一年只在春天祭祀一次。永乐十二年，在北京莲花池修建了马神祠。南京的马神，则由南太仆寺掌管。
一开始啊，南京有十个庙要祭祀。北极真武大帝在三月三日和九月九日祭祀；道林真觉普济禅师在三月十八日祭祀；都城隍庙在八月祭祀帝王后的一天祭祀；祠山广惠张王庙在二月十八日祭祀；五显灵顺庙在四月八日和九月二十八日祭祀。这些庙都是南京太常寺的官员负责祭祀的。
然后呢，还有汉朝秣陵尉蒋忠烈公子的庙，晋朝成阳卞忠贞公的庙，宋朝济阳曹武惠王的庙，南唐刘忠肃王的庙，元朝卫国忠肃公的庙，这五个庙都在每年的正月、四月、七月、十月初一和年底由应天府的官员祭祀。不过，蒋忠烈的庙额外还有一个四月二十六日的祭祀。加上功臣庙，一共是十一个庙。
后来又增加了四个庙：关公庙，是洪武二十七年建在鸡笼山的，一开始叫“汉前将军寿亭侯庙”，嘉靖十年才纠正了错误，改叫“汉前将军汉寿亭侯庙”。这个庙每年的正月、四月、七月、十月初一和年底由应天府的官员祭祀，另外，南京太常寺的官员会在五月十三日祭祀。还有天妃庙，永乐七年被封为“护国庇民妙灵昭应弘仁普济天妃”，南京太常寺的官员会在正月十五日和三月二十三日祭祀。太仓神庙，在仲春和秋天的望日由南京户部官员祭祀。司马、马祖、先牧这三个神庙，在春秋两季的仲月中旬择日由南京太仆寺官员祭祀。
这些庙的祭祀规格都差不多，但真武大帝和真觉禅师的祭祀规格要稍微简单一些。
明太祖把功臣们都安排进太庙享祭，还另外在鸡笼山给他们建了一座庙。一共二十一人，死的就塑个像，活着的就空着位置。正殿供奉的是：中山武宁王徐达、开平忠武王常遇春、岐阳武靖王李文忠、宁河武顺王邓愈、东瓯襄武王汤和、黔宁昭靖王沐英。羊两只，猪两只。西边配殿是：越国武庄公胡大海、梁国公赵德胜、巢国武壮公华高、虢国忠烈公俞通海、江国襄烈公吴良、安国忠烈公曹良臣、黔国威毅公吴复、燕山忠愍侯孙兴祖。东边配殿是：郢国公冯国用、西海武庄公耿再成、济国公丁德兴、蔡国忠毅公张德胜、海国襄毅公吴桢、蕲国武义公康茂才、东海郡公茅成。羊两只，猪两只。两边的厢房里各立一块牌位，上面写着“故指挥千百户卫所镇抚之灵”。羊十只，猪十只。每年四孟（孟春、孟夏、孟秋、孟冬）和岁末，都派驸马都尉去祭祀。
一开始，胡大海他们死后，画像先放在卞壸、蒋子文庙里。等功臣庙建好了，才把他们的画像移了过去。永乐三年，因为中山王徐达功劳最大，皇上又下令，每年正旦、清明、中元、孟冬、冬至，都派太常寺的官员去他家庙祭祀，祭品用少牢（古代祭祀用的牲畜）。
北京城里祭祀的庙宇有九座。真武庙，永乐十三年建的，祭祀的是北极佑圣真君。正德二年改名叫灵明显佑宫，在海子桥东边，祭祀的日子和南京一样。东岳泰山庙，在朝阳门外，三月二十八祭祀。都城隍庙，五月十一日祭祀。汉寿亭侯关公庙，永乐年间建的。成化十三年，又奉旨建了一座庙在宛平县东边，五月十三祭祀。这些庙都是由太常寺的官员祭祀。京都太仓神庙，建在太仓，由户部官员祭祀。司马、马祖、先牧神庙，由太仆寺官员祭祀。
宋朝文丞相的祠堂，永乐六年的时候，由太常博士刘履节提议，建在了顺天府学（北京府学）的西边。元世祖的庙，嘉靖年间就撤了。这两个地方，每年二月和八月十五，顺天府的官员都要去祭祀。
洪恩灵济宫，祭祀的是徐知证和徐知谔两位。永乐十五年，庙宇建在了皇城的西边。元旦、冬至和皇帝的生日，内阁、礼部和内务府各派一名官员去祭祀。徐知证、徐知谔的生日，则由礼部官员祭祀。弘治年间，大学士刘健等人请求不要再派内阁大臣去祭祀了。到了嘉靖年间，又改成了派太常寺的官员去。
至于荣国公姚广孝，洪熙元年的时候，被列入太庙从祀。嘉靖九年，他的庙被撤了，祭祀地点改到了大兴隆寺，在大兴隆寺皇城西北角。后来大兴隆寺毁了，又把他的牌位移到了崇国寺。
东岳庙和都城隍庙用太牢祭祀，五庙用少牢祭祀，真武庙和灵济宫则用素斋。
洪武元年，皇帝命令中书省下令到各郡县，调查应该祭祀的神祇。凡是名山大川、圣帝明王、忠臣烈士，只要对国家有功劳，或者对百姓有恩惠的，都记录在祀典里，让有关部门按时祭祀。第二年，又下诏说，天下那些神祇，只要经常对百姓有功德，事迹显著的，即使不在祀典里，也不准人们毁坏他们的祠宇。第三年，又规定了诸神的封号，那些后世溢美之辞，一律取消。天下那些神祠，不在祀典里的，就是淫祠，有关部门不准祭祀。弘治元年，礼科给事中张九功上奏说：“祀典正了，人心才能正。现在朝廷除了例行祭祀外，还有释迦牟尼文佛、三清三境九天应元雷声普化天尊、金玉阙真君元君、神父神母，各宫观里还有水官星君、诸天诸帝的祭祀，这不是规范天下的做法啊！”皇帝把奏章交给礼部，礼部尚书周洪谟等人又说：
释迦牟尼佛是出生在西方的印度，信奉佛教的人认为佛的法身是他的本性，报身是他的功德，把法身、报身、真身合起来说是三种身，其实都是同一个人。道教尊老子为祖师。朱熹说过：“玉清元始天尊既不是老子的法身，上清太上道君也不是老子的报身，就算有这两个神像，也不是和老子是同一个人。而老子又自称是上清太上老君，这明显是模仿佛教，但却弄错了。”
所以，以后凡是遇到万寿节之类的节日，都不准再举行吉祥斋醮；遇到丧事，也不准再举行荐扬斋醮。大兴隆寺和朝天宫，都停止官方祭祀。
北极中天星主紫微大帝，指的是北极五星，位于紫微垣中。正统年间，修建了紫微殿，设置神像进行祭祀。祭祀星辰是古代的礼仪，但这把星辰拟人化，称之为大帝，查阅古代祭祀典籍，根本找不到依据。
雷声普化天尊，道教认为他是掌管五雷的神，又把六月二十四日定为天尊显灵的日子，所以每年这一天都要派官员到显灵宫祭祀。可是，风、云、雷、雨都在南郊一起祭祀，山川坛还有秋季的祭祀，所以这个祭祀也应该取消。
祖师三天扶教辅玄大法师真君，史书记载说：“汉朝的张道陵擅长用符咒治病。唐朝天宝年间，宋朝熙宁、大观年间，多次被封为正一靖应真君，他的子孙也得到封号。我们朝代仍然沿袭正一派嗣教真人的封号。”但是宋朝的邵伯温说：“张鲁的祖先张陵和父亲张衡，用符咒法术相互传授，自称师君。”现在每年正月十五日是张陵的生日，派官员到显灵宫祭祀，这也不是古代祭祀典籍里有的。
大小青龙神，记载说：“有个和尚叫卢，住在西山。有两个童子侍奉他。当时久旱不雨，童子进入潭中变成两条青龙，于是就下雨了。后来皇上赐给卢和尚‘感应禅师’的称号，修建寺庙设置神像，并在潭上另建龙祠。宣德年间，修建了大圆通寺，给这两条龙加封号，春秋两季祭祀。”最近连年干旱，祈祷也没有应验，不足以证明它们的神力。
说梓潼帝君啊，记载里说他姓张名亚子，住在蜀地的七曲山。他在晋朝当官时战死了，人们为他建了庙。唐朝和宋朝多次封他，最后封为英显王。道家说这是天帝命令梓潼掌管文昌府和人间的功名禄位，所以元朝给他加封为帝君，全国各地的学校里也都有他的庙。景泰年间，京城旧庙被拆了重建，每年二月三日是他的生日，朝廷会派人祭祀。梓潼神灵显赫在蜀地，庙就在蜀地供奉最合适。文昌六星和他根本没关系，应该下令取消与文昌星的关联。全国各地学校里的梓潼庙，都应该拆掉。
接下来说北极佑圣真君，其实就是玄武七宿，后人把他尊为真君，庙里塑他的像时，下面还有龟蛇。宋真宗避讳，改叫他真武。靖康初年，又加封为佑圣助顺灵应真君。图志上说：真武是净乐王太子，在武当山修炼，功成之后飞升成仙，奉了上帝的命令镇守北方。他披散着头发，赤着脚，竖着黑色的旗帜。这些都是道家附会的说法。朝廷御制的碑文中说，太祖皇帝平定天下，真武大帝暗中帮助很大，所以曾在南京建庙祭祀他。太宗皇帝靖难时，真武大帝也显灵相助，所以又在京城东北角和武当山重建了庙宇。两京每年都要在朔望日派官员去祭祀，武当山更是专门设官负责祭祀事务，宪宗皇帝还曾铸造金像。现在建议只保留洪武年间的旧例，每年三月三日和九月九日用素斋祭祀，由太常寺官员去祭祀，其他的都取消。
最后是崇恩真君和隆恩真君。道家说崇恩姓萨名坚，是西蜀人，宋徽宗时跟王侍宸、林灵素这些人学法，很灵验。隆恩真君，就是玉枢火府的天将王灵官，也曾经跟萨坚学过符法。永乐年间，因为有个道士周思得能传授灵官的法术，所以在皇城西边建了天将庙和祖师殿。宣德年间，改名为大德观，封他们俩为真君。成化初年，又改名为显灵宫。每年都要更换袍服，花费巨大。最近几年祈祷都不灵验了，也应该取消祭祀了。
话说，那些金阙上帝、玉阙上帝啊，他们的故事是这样的：记载上说，他们是五代时期徐温的儿子徐知证和徐知谔。朝廷的碑文上记载，太宗皇帝曾经身体不适，向他们祈祷后就灵验了，所以就大规模修建了闽地的庙宇，春秋两季都要祭祀。还在京城建了庙，封他们为金阙真君、玉阙真君。到了正统、成化年间，又不断加封，最后封为上帝。每个月朔望和节日都要派官员祭祀，按时献上新祭品，四季还要更换他们的衣服。可是呢，这些神仙的家世和事迹，其实也没什么特别之处，他们僭越称帝的称号应该取消，那些浪费的祭祀也应该节省下来。
至于他们的父亲——神父圣帝，母亲——神母元君，以及金玉阙元君，其实就是徐知证和徐知谔的父母和他们的妻子。宋朝的时候，封他们的父亲徐温为忠武真人，母亲田氏为仁寿仙妃，他们的妻子也都被封为仙妃。永乐到成化年间，又多次加封，现在这些称号也应该取消，祭祀也该停了。
再说说东岳泰山神，泰山是五岳之首，庙宇建在泰安州山下。每年南郊祭祀和山川坛祭祀的时候，都要一起祭拜它。现在朝阳门外还有一座元朝时期的东岳庙，朝廷一直没把它拆掉。既然已经专门在宫内祭祀它了，而且在郊坛祭祀时也一起祭拜了，那么这座庙的祭祀就显得多余，太繁琐了。
还有京城的城隍神，庙原来在顺天府西南，五月十一日是它的诞辰，所以这一天以及其他节日都要派官员祭祀。可是城隍神，它又不是人也不是鬼，哪来的诞辰？况且南郊秋祭的时候也已经一起祭祀了，那么它诞辰和节日的祭祀就完全没必要了，这些都应该取消。
最后，经过讨论，决定修建斋醮，派官员祭告，东岳、真武、城隍庙、灵济宫的祭祀都维持原样。但是，徐知证和徐知谔兄弟以及他们的父母妻子的“帝”号要取消，保留原来的封号，他们的冠服等物品要换下来烧掉，其他的就按照讨论的结果执行。
按照以前的祭祀制度，太祖皇帝在位的时候，应天府祭祀陈乔、杨邦乂、姚兴、王鉷；成都祭祀李冰、文翁、张咏；均州祭祀黄霸；密县祭祀卓茂；松江祭祀陆逊、陆抗、陆凯；龙州祭祀李龙迁；建宁祭祀谢夷甫；彭泽祭祀狄仁杰；九江祭祀李黼；安庆祭祀余阙、韩建之、李宗可。
宣宗皇帝在位的时候，高邮祭祀耿遇德。英宗皇帝在位的时候，豫章祭祀韦丹、许逊；无锡祭祀张巡。宪宗皇帝在位的时候，崖山祭祀张世杰、陆秀夫。孝宗皇帝在位的时候，新会祭祀宋慈元杨后；延平祭祀罗从彦、李侗；建宁祭祀刘子翚；乌撒祭祀潭渊；庐陵祭祀文天祥；婺源祭祀朱熹；都昌祭祀陈澔；饶州祭祀江万里；福州祭祀陈文龙；兴化祭祀陈瓒；湖广祭祀李芾；广西祭祀马慨。
这些都是历代有名的大臣，他们的功绩非常显著。地方长官上报请求，礼部官员审核后，这些事情都记录在正史里，时间年月都可以查证。至于明朝那些抵抗外敌、为国捐躯的忠臣义士，有的因为功劳，有的因为学问品德，有的因为正直刚烈，有的因为为国捐躯，他们的事迹都记载在史书里，刻在碑石上，数不胜数。
其中比较重要的，比如鄱阳湖忠臣祠祭祀丁普郎等三十五人，南昌忠臣祠祭祀赵德胜等十四人，太平忠臣庙祭祀花云、王鼎、许瑗，金华忠臣祠祭祀胡大海，这些都是太祖皇帝亲自下令设立的。后来，通州祭祀常遇春，山海关祭祀徐达，苏州祭祀夏原吉、周忱，淮安祭祀陈瑄，海州卫祭祀卫青、徐安生，甘州祭祀毛忠，榆林祭祀余子俊，杭州祭祀于谦，萧山祭祀魏骥，汀州祭祀王得仁，广州祭祀杨信民、毛吉，云南祭祀沐英、沐晟，贵州祭祀顾成，庐陵祭祀刘球、李时勉，广信祭祀邓颙，宝庆祭祀贺兴隆，上杭祭祀伍骥、丁泉，庆远祭祀叶祯，云南祭祀王祎、吴云，青田祭祀刘基，平阳祭祀薛瑄，杭州祭祀邹济、徐善述，金华祭祀章懋，这些人的事迹都广为人知，很容易查到。
其他的郡县、山川、龙神、忠烈之士，以及那些祈祷灵验而被祭祀的人，在《会典》里记载得更加详细。
话说古代有个祭祀泰厉的仪式，这泰厉啊，可不是什么好东西，是凶神恶鬼的意思。《春秋传》里就说了，“鬼有所归，乃不为厉。” 意思就是说，鬼有了安身之处，就不会作祟害人了。 这祭祀的规矩在《祭法》里也有记载：皇帝祭祀泰厉，诸侯祭祀公厉，大夫祭祀族厉，这等级制度可真是森严啊。 你看《士丧礼》里还写着“疾病祷于厉”，郑玄注里解释说，汉朝的时候，民间都在秋天祭祀厉神，可见这祭祀厉神的风俗，从上到下都流行过。 可后来不知道为啥，这祭祀就没人做了。
直到洪武三年，朱元璋重新规定，要在京城祭祀泰厉，专门在玄武湖里建了个祭坛。每年清明节和十月初一都要派官员去祭祀。 祭祀之前七天，还要先通知城隍爷一声。 祭祀那天，京城和各省的城隍神像就摆在祭坛上，那些其他的鬼神就摆在坛子下东西两边。祭品也很丰盛，三只羊，三只猪，还有三石米饭。 各省的王也祭祀本地的厉神，府州祭祀郡厉，县里祭祀邑厉，这些祭祀都在城北设坛，一年祭祀两次，跟京城一样。 至于乡下，就祭祀乡厉了。 后来又规定了郡邑厉和乡厉的祭祀时间，分别是清明节、七月十五和十月初一。
