吴当，字伯尚，是吴澄的孙子。吴当从小就继承了祖上的家教，以聪颖好学、踏实认真而闻名。长大后，他精通经史子集，跟着爷爷去京城，考中了国子生。过了很久，爷爷去世了，以前跟着爷爷学习的学生，都到吴当这里来完成学业。至正五年，因为父亲的功劳，他被任命为万亿四库照磨，还没上任，就因为别人的推荐改任国子助教。他认真讲课，严格要求学生学习，学生们都很喜欢他。正好朝廷下令修撰辽、金、宋三史，吴当参与了编纂工作。书写完成后，他被任命为翰林修撰。七年后，升任国子博士；次年，升任监丞；十年后，升任司业；次年，升任朝林待制；又一年，改任礼部员外郎。至正十三年，提升为监察御史，不久又回到国子司业的职位。次年，升任礼部郎中；又一年，任翰林直学士。
那时候江南起兵已经五年了，有大臣推荐吴当，说他长期居住在江西，熟悉江西的风土人情，而且才能出众，可以胜任政务。朝廷就特地任命他为江西肃政廉访使，让他和江西行省参政火你赤、兵部尚书黄昭一起，招捕江西各郡的叛军，并给予便宜行事之权。吴当看到朝廷兵力不足，接到命令后到达江南，就立即招募民兵，从浙江进入福建。到达江西建昌地区，招安了新城孙塔，擒杀了李三。道路打通后，就进攻南丰，叛军头目郑天瑞逃跑了，郑天瑞的儿子自刎而死。至正十六年，调动检校章迪率领本部军队，与黄昭一起夹击抚州，剿杀了首领胡志学，又收复了崇仁、宜黄。这样，建昌、抚州两郡就平定了。当时，参知政事朵歹负责抚州、建昌两郡的军事，多年没有战功。他嫉妒吴当屡屡获胜，功劳超过了他，又认为南方人不应该统领军队，于是就造谣说吴当和黄昭都和叛军勾结。朝廷下令解除他们两人的兵权，把吴当任命为抚州路总管，黄昭任命为临江路总管，都听从平章火你赤的指挥。火你赤杀了吴当的幕僚范淳和章迪，将士们都很愤怒不满，吴当劝慰他们说：“皇上的命令不能违抗啊！”而火你赤又上奏章说：“这两个人，难以治理百姓。”不久，朝廷下令罢免吴当和黄昭的总管职务，并革除他们的名籍。
十八年过去了，火你赤从瑞州回到龙兴府，当、昭两人都跟着军队，不敢回去。之前啊，当和昭上报平定贼寇的战功奏章，他们是从广东走海路，还没到京城呢，结果火你赤他们先把奏章送到了，所以朝廷就责怪当和昭，把他们都贬官了。等朝廷收到当和昭的战功奏章后，才知道之前是冤枉了他们，于是就下诏书提升当为中奉大夫、江西行省参知政事，昭为湖广行省参知政事。
可是圣旨还没下达，陈友谅就已经攻陷了江西好几个郡县。火你赤丢下城池逃跑了，当呢，就戴上黄帽子，穿上道士的衣服，闭门不出，整天埋头写书。陈友谅派人去请他出来做事，当就躺在床上不吃东西，誓死不从。没办法，陈友谅的人只好把他的床抬上船，送到了江州，把他关了一年，可他始终没屈服。后来，他就隐居在庐陵吉水县的谷坪。一年多以后，因为生病去世了，享年六十五岁。他留下的著作，有《周礼纂言》和《学言稿》。
